質譜分析入門讀本

您可以計算出離子強度的總和，並將結果相對時間（層析滯留時間）繪圖，得到總離子流層析圖(TIC)，TIC看起來很像UV偵測器等分光光度計輸出的譜圖。在MS數據中，一條軸代表離子強度；另一條軸可以是時間或在特定時間採集的數位樣本（即譜圖）。您可以單獨顯示每張譜圖，就像現代數位攝影機拍攝的連續影像一樣，這些影像的本質就是一連串高速靜止照片。

您可以採以簡單但非常有用的技術：例如減少所選離子層析圖中的數據陣列或使用數位濾波器降低雜訊，就像只顯示每個數位樣本（基峰離子層析圖或BPI）中強度最高的峰值一樣。

數據輸出、存儲與擷取

多年來，軟體設計已經獨立成一項專業技術，不再只是設定採集參數的一種方法。如今，操作員可以使用操作系統和數據系統進行複雜的儀器控制。

這些專業套裝軟體大幅發展，擁有以下功能：

• 工作流程控制，例如開放存取（亦稱「無人値守系統」）- 訓練有素的操作員可以為大量非專業使用者提供完整的LC或GC/MS方法，讓這些使用者能夠存取先進技術，因此不需大量培訓。非專業者可能只需要偶爾使用儀器鑑定化合物的特性或純度。他們不需成為熟練的操作員也能順利使用這套系統。
• 數據縮減應用程式 - 例如，這些套裝軟體可能有助於鑑定代謝物，或是以數千種獨特化學個體的複雜混合物開發出生物標誌物。這類應用程式通常借助主成分分析軟體(PCA)等「專家」系統增強功能，這樣的系統能夠檢查隱匿在大量輸出中的數據趨勢。

數據管理的需求正迅速超越因應這些需求的能力。高解析度、準確質量數據能夠以高達1 GB/h的驚人速度生成。不僅僅是生命科學研究人員，越來越多仰賴高通量製程的從業人員也在產生如此大量的數據，例如表徵分析代謝物的存在及其生物轉化的人員。假設每台質譜儀每天產生24 GB的數據，五台這樣的質譜儀經過180天的運轉後，您將面臨存儲、擷取、分類及以其他方式處理21.6 TB數據的需求。

無論是何種數據場景，首先一定要知道我們打算如何處理所收集到的數據。這些數據不同於電子郵件，電子郵件只傳遞訊息，此後幾乎沒有任何作用；線上數據會隨著時間推移越來越有價值，因為數據檔案中的生物、製藥和物理化學量測值會不斷累積。不過，隨著價值增加，確保數據便於取得的成本也越來越高。有鑑於數據檔案的大小不斷增加，必須存取這些檔案的時間越來越長，解決方案可能會納入某種形式的階層存儲管理。因此，可以讓一小部分數據可立即存取（或處於「活動狀態」），而其餘數據則是在連續階段中持續處理，或者加上長期封存標記。

請參閱MS - The Practical Art, LCGC

• Profiles in Practice Series: The High Speed State of Information and Data Management, Vol.23 No.6, June 2005
  • 這項參考資料為什麼重要：數據輸出日益複雜且龐大，封存與擷取以及結構式存儲開始成為重要議題。
    
• Hardware and software challenges for the near future: Structure elucidation concepts via hyphenated chromatographic techniques, Vol.26, No.2 February 2008
  • 這項參考資料為什麼重要：現代實驗往往包含MS和正交或串聯分析系統，這項參考資料探討這些實驗所製造出來的數據量。