质谱入门指南

您可以对离子的强度求和，并将它们相对于时间（色谱保留时间）作图，得到总离子流色谱图(TIC)，TIC看起来很像UV检测器等分光光度计的输出谱图。在MS数据中，一条轴代表离子强度；另一条轴可以是时间，也可以是特定时间点采集的数字样本（即质谱图）。您可以单独显示每一幅质谱图，就像现代数码摄影机摄取的一系列图像一样，它们本质上是高速摄取的一系列静态照片。

您可以采取诸如减少选定离子色谱图中的数据阵列或应用数字过滤器这样简单但非常有用的方法来减少噪音，例如，仅显示每个数字样本中强度最大的峰（基峰离子色谱图，或BPI）就可以达到这个目的。

数据输出、存储和检索

多年来，软件设计已成为一门独立的专业，不再仅仅是设置采集参数的一种手段。今天，操作人员可以借助操作和数据系统对仪器进行复杂的控制。

很多专业软件包都已经发展出以下功能：

• 工作流程控制，例如开放访问（也称为“无人值守系统”）- 训练有素的操作人员可以为大量非专业用户提供完整的LC或GC/MS方法，让他们无需接受大量培训也能使用先进技术。非专业人士可能只需要偶尔使用仪器来鉴定化合物或分析纯度。他们不需要先成为熟手就能使用这类系统。
• 数据缩减应用程序 - 举个例子，这些软件包可以帮助我们鉴别代谢物，或是从复杂混合物中的数千种特有化学实体中开发生物标志物。这些应用程序通常会借助诸如主成分分析软件(PCA)之类的“专家”系统来强化功能（PCA软件可以分析出藏匿在海量输出中的数据趋势）。

人们对于数据管理的需求正迅速超出满足这些需求的能力。高分辨率、准确质量数数据能够以高达1 GB/h的惊人速度生成。不仅生命科学领域的研究人员，越来越多依赖高通量工作流程（例如表征代谢物的存在及其生物转化）的行业从业者也在产出如此海量的数据。假设一台质谱仪每天产生24 GB的数据，那么，五台这样的质谱仪在运行180天后，您将面临存储、检索、分类和以其他方式处理21.6太字节(TB)数据的需求。

在所有的数据场景中，亟待解决的首要问题是我们打算如何处理采集到的数据。与电子邮件不同（电子邮件传达信息之后几乎就没什么用处了），在线数据会随着时间推移变得越来越有价值，因为生物、药物和物理化学测定值会持续以数据文件的形式累积。但随着这种价值增加，确保数据可访问性的成本也越来越高。考虑到不断增大的数据文件，以及要求能够存取数据的时间长度，或许需要采取包含某种形式的分层存储管理的解决方案。这样一来，可让一小部分数据供用户随时存取（或处于“活动”状态），而其余数据则相继予以处理或指定用于长期存档。

参考文献：MS - The Practical Art, LCGC

• Profiles in Practice Series: The High Speed State of Information and Data Management, Vol.23 No.6, June 2005
  • 文献要点：随着数据输出变得越来越复杂和庞大，归档和检索以及结构化存储成为了关键问题。
    
• Hardware and software challenges for the near future: Structure elucidation concepts via hyphenated chromatographic techniques, Vol.26, No.2 February 2008
  • 文献要点：探讨了现代实验所产生的数据量，通常包括使用MS和正交或联用分析系统的实验。