Análisis de oligonucleótidos sintéticos

Análisis de oligonucleótidos sintéticos

Desde la preparación de muestra hasta la separación cromatográfica, pasando por la detección óptica y de masas, y el análisis de datos y la obtención de informes con cumplimiento normativo, las herramientas de Waters para el análisis de oligonucleótidos, especialmente diseñadas para su finalidad específica, ofrecen un rendimiento y una productividad de vanguardia, y cuentan con el respaldo de nuestros equipos de soporte y servicio técnico globales para acelerar sus esfuerzos de desarrollo terapéutico, diagnóstico y de investigación.

Desde la preparación de muestra hasta la separación cromatográfica, pasando por la detección óptica y de masas, y el análisis de datos y la obtención de informes con cumplimiento normativo, las herramientas de Waters para el análisis de oligonucleótidos, especialmente diseñadas para su finalidad específica, ofrecen un rendimiento y una productividad de vanguardia, y cuentan con el respaldo de nuestros equipos de soporte y servicio técnico globales para acelerar sus esfuerzos de desarrollo terapéutico, diagnóstico y de investigación.


Descripción general

El resurgimiento en el desarrollo de productos terapéuticos con oligonucleótidos ha dado lugar a la creación de proyectos en desarrollo en toda la industria. Al trabajar a nivel de transcripción y traducción de genes, estos fármacos de ácidos nucleicos cortos son muy prometedores para muchos trastornos hereditarios y dolencias comunes por igual.

Las herramientas y técnicas de LC-MS de Waters desempeñan un papel de vital importancia en la confirmación de la identidad y la pureza de estos fármacos, así como en la cuantificación de su presencia en los biofluidos.


Aplicaciones

Con los productos terapéuticos con oligonucleótidos, la secuencia y la ubicación de los nucleótidos modificados son de vital importancia para su función, estabilidad y eficacia. La fragmentación por LC-MS/MS es una técnica clave que puede proporcionar este nivel de confirmación de secuencias, y las herramientas automatizadas de análisis de datos y generación de informes hacen que el proceso sea rápido y sencillo.

Con los productos terapéuticos con oligonucleótidos, la secuencia y la ubicación de los nucleótidos modificados son de vital importancia para su función, estabilidad y eficacia. La fragmentación por LC-MS/MS es una técnica clave que puede proporcionar este nivel de confirmación de secuencias, y las herramientas automatizadas de análisis de datos y generación de informes hacen que el proceso sea rápido y sencillo.


Notas de aplicación

Notas de aplicación

Los oligonucleótidos sintéticos contienen muchas impurezas relacionadas con el proceso y el producto, incluidas secuencias de fallo nX truncadas, variantes oxidadas (p. ej.: Conversiones PS a PO) y variantes desaminadas, y para especies de dsRNA (p. ej.: siRNA) los componentes monocatenarios se consideran impurezas. Para las presentaciones normativas, estas impurezas deben identificarse y caracterizarse correctamente.

Los oligonucleótidos sintéticos contienen muchas impurezas relacionadas con el proceso y el producto, incluidas secuencias de fallo nX truncadas, variantes oxidadas (p. ej.: Conversiones PS a PO) y variantes desaminadas, y para especies de dsRNA (p. ej.: siRNA) los componentes monocatenarios se consideran impurezas. Para las presentaciones normativas, estas impurezas deben identificarse y caracterizarse correctamente.


Notas de aplicación

Notas de aplicación

El análisis cuantitativo de oligonucleótidos de biofluidos requiere enfoques de preparación de muestra eficaces para lograr la máxima recuperación, reproducibilidad y límites de detección más bajos. Las herramientas de preparación de muestras, cromatografía líquida y espectrometría de masas de Waters están diseñadas para proporcionar la sensibilidad, la repetitibilidad y la productividad necesarias para los proyectos de bioanálisis de oligonucleótidos.

El análisis cuantitativo de oligonucleótidos de biofluidos requiere enfoques de preparación de muestra eficaces para lograr la máxima recuperación, reproducibilidad y límites de detección más bajos. Las herramientas de preparación de muestras, cromatografía líquida y espectrometría de masas de Waters están diseñadas para proporcionar la sensibilidad, la repetitibilidad y la productividad necesarias para los proyectos de bioanálisis de oligonucleótidos.


Notas de aplicación

Notas de aplicación


Caso práctico: BioSpring implementa flujos de trabajo LC-MS de Waters para oligonucleótidos para ampliar la cartera existente

Conozca cómo BioSpring aprovechó el sistema BioAccord LC-MS de Waters y Vion IMS QTof con waters_connect, listos para el cumplimiento normativo, para garantizar la integridad de los datos, dar soporte a tiempos de respuesta más cortos y cumplir los requisitos normativos a medida que ampliaba sus servicios de análisis y fabricación de oligonucleótidos.

Conozca cómo BioSpring aprovechó el sistema BioAccord LC-MS de Waters y Vion IMS QTof con waters_connect, listos para el cumplimiento normativo, para garantizar la integridad de los datos, dar soporte a tiempos de respuesta más cortos y cumplir los requisitos normativos a medida que ampliaba sus servicios de análisis y fabricación de oligonucleótidos.


Soluciones


Los sistemas LC y LC-MS de Waters ofrecen un rendimiento de separaciones y una sensibilidad líderes para el análisis de oligonucleótidos sintéticos.

Los sistemas LC y LC-MS de Waters ofrecen un rendimiento de separaciones y una sensibilidad líderes para el análisis de oligonucleótidos sintéticos.

Adsorción ultrabaja para una sensibilidad y reproducibilidad máximas

Adsorción ultrabaja para una sensibilidad y reproducibilidad máximas

Los sistemas y columnas MaxPeak Premier eliminan la imprevisibilidad de las pérdidas de analitos debidas a interacciones con metales, que pueden ser especialmente pronunciadas con los oligonucleótidos cargados negativamente.

  • Characterization
  • Impurities Analysis
  • Quantitative Analysis

Para una monitorización eficiente de los atributos del producto durante todo el desarrollo

Para una monitorización eficiente de los atributos del producto durante todo el desarrollo

Simplifique los análisis biofarmacéuticos de LC-MS de alto rendimiento para todos los usuarios con el sistema LC-MS BioAccord de Waters con ACQUITY Premier, una plataforma integrada preparada para el cumplimiento normativo que se puede implementar desde los laboratorios de descubrimiento hasta GxP.

  • Characterization
  • Impurities Analysis
  • Quantitative Analysis

Cobertura completa de alta resolución para una caracterización segura

Cobertura completa de alta resolución para una caracterización segura

Acelere la caracterización de oligonucleótidos sintéticos con el sistema de sobremesa HRMS de alto rendimiento Xevo G3 QTof, que proporciona resultados cualitativos y cuantitativos exactos.

  • Characterization
  • Impurities Analysis
  • Quantitative Analysis

Sensibilidad exquisita para los análisis de cuantificación

Sensibilidad exquisita para los análisis de cuantificación

Amplíe el alcance del análisis de sensibilidad más avanzado con el espectrómetro de masas de triple cuadrupolo Xevo TQ Absolute de Waters, que ofrece niveles sin precedentes de fiabilidad, reproducibilidad y rendimiento para las aplicaciones de oligonucleótidos.

  • Quantitative Analysis

El software de Waters agiliza la adquisición, el procesamiento y la generación de informes de datos de los resultados del análisis de oligonucleótidos.

El software de Waters agiliza la adquisición, el procesamiento y la generación de informes de datos de los resultados del análisis de oligonucleótidos.

Simplifique el procesamiento y el análisis de datos

Simplifique el procesamiento y el análisis de datos

Acelere el proceso desde el análisis de muestra hasta la toma de decisiones con waters_connect para el análisis biofarmacéutico con aplicaciones para el análisis de masa intacta, la confirmación de secuencias, la monitorización de procesos y mucho más.

  • Quantitative Analysis
  • Impurities Analysis
  • Sequence and Modification Confirmation

Columnas de oligonucleótidos, patrones y herramientas de preparación de muestra diseñadas específicamente para ofrecer el máximo rendimiento y productividad.

Columnas de oligonucleótidos, patrones y herramientas de preparación de muestra diseñadas específicamente para ofrecer el máximo rendimiento y productividad.

Sensibilidad mejorada con una estabilidad inigualable del pH y la temperatura

Sensibilidad mejorada con una estabilidad inigualable del pH y la temperatura

Las columnas de fase reversa MaxPeak Premier Oligonucleotide BEH C18 ofrecen una tolerancia alta a la temperatura y al pH, una resolución excepcional y una adsorción ultrabaja para mejorar la sensibilidad y la reproducibilidad. Las pruebas de control de QC específicas del analito en cada lote de sorbentes garantizan el rendimiento entre lotes.

  • Impurities Analysis
  • Quantitative Analysis
  • Characterization

Kits de extracción de alta recuperación para cuantificación por LC-MS

Kits de extracción de alta recuperación para cuantificación por LC-MS

Logre una recuperación hasta 2 veces mayor, un flujo de trabajo optimizado y una mayor sensibilidad y repetitibilidad de LC-MS con los kits y componentes de SPE de OligoWorks para la extracción de compuestos terapéuticos y metabolitos de oligonucleótidos a partir de biofluidos.

  • Quantitative Analysis

Evalúe el rendimiento de las columnas y del sistema con confianza

Evalúe el rendimiento de las columnas y del sistema con confianza

Elimine la necesidad de preparar mezclas complejas con los patrones de oligonucleótidos con lote certificado y en paquete de Waters, que ofrecen facilidad de uso y tranquilidad a la hora de realizar separaciones de oligonucleótidos.

  • Quantitative Analysis
  • Impurities Analysis
  • Characterization

Selectividad ortogonal con cromatografía sin emparejamiento iónico

Selectividad ortogonal con cromatografía sin emparejamiento iónico

La cromatografía de intercambio aniónico (AEX) y la cromatografía de interacción hidrofílica (HILIC) proporcionan selectividad ortogonal y opciones de LC sin apareamiento iónico. Waters ofrece tanto columnas AEX débiles como fuertes, así como columnas BEH HILIC con enlace amida, que proporcionan una variedad de nuevas opciones de métodos.

  • Quantitative Analysis
  • Impurities Analysis
  • Characterization

Aumente la eficacia y reduzca el tiempo de espera con soluciones de automatización de laboratorio verificadas

Aumente la eficacia y reduzca el tiempo de espera con soluciones de automatización de laboratorio verificadas

Mejore la eficacia y el rendimiento de la preparación de muestras

Mejore la eficacia y el rendimiento de la preparación de muestras

Agilice la extracción de oligonucleótidos de biofluidos para análisis cuantitativo de LC-MS con flujos de trabajo verificados que ayuden a minimizar la variabilidad, mejorar la trazabilidad y simplificar la transferencia de métodos.

  • Quantitative Analysis
  • Impurities Analysis
  • Sequence and Modification Confirmation

Está a solo un clic de conseguir el éxito

Está a solo un clic de conseguir el éxito

Optimice la productividad y el éxito de su laboratorio con Waters Global Services. Mantenga el máximo rendimiento del sistema, reduzca al máximo el tiempo de inactividad, supere los retos de aplicaciones y cumpla con los estrictos requisitos de cumplimiento normativo.

  • Quantitative Analysis
  • Impurities Analysis
  • Sequence and Modification Confirmation

Haga que la ciencia sea más accesible con Waters Capital

Haga que la ciencia sea más accesible con Waters Capital

Maximice los recursos y minimice el riesgo con las opciones de pago de Waters Capital, que incluyen la actualización de equipos obsoletos, la obtención de soporte personalizado y la combinación de servicios en un único pago mensual.

  • Quantitative Analysis
  • Impurities Analysis
  • Sequence and Modification Confirmation

Los datos hablan por sí solos

Los datos hablan por sí solos
Evalúe el carácter inerte del sistema ACQUITY Premier UPLC y la columna ACQUITY Premier OST utilizando el oligómero de 21 nt: Comparación del cromatograma UV de la concentración más baja detectable (0,5 nM o 5 femtomoles del oligonucleótido de 21 iones cargado en la columna) con la anterior inyección de blanco.
Curvas de calibración de GEM91 utilizando una columna de acero inoxidable y un sistema convencional (rojo), una columna ACQUITY Premier y un sistema convencional (azul) y una columna y sistema ACQUITY Premier (violeta). Las diferentes pendientes indican diferencias claras en la recuperación utilizando las columnas y los sistemas probados.
Cromatogramas TUV y TIC que muestran el rendimiento del sistema BioAccord cuando el patrón OST 1 μM se diluyó 100 veces (carga de muestra de 100 fmoles). Los cinco oligonucleótidos principales se detectan claramente en los cromatogramas de UV y TIC, lo que indica que el sistema de LC-MS y el método tienen la sensibilidad adecuada para detectar impurezas de oligonucleótidos de bajo nivel.
Se logró la confirmación de la secuencia en escalera completa de MS/MS para la secuencia de ssRNA de 5'-UCGUCAAGCGAUUACAAGGTT-3'. El experimento se llevó a cabo utilizando el pico M4- como ion precursor. Las asignaciones de los picos de fragmentación se han realizado comparándolas con las masas teóricas mediante cálculos sencillos en archivos de Excel. MaxEnt3 se utilizó para la deconvolución y la eliminación de isótopos de la carga.

Seminarios web y recursos



  • Folleto

Folleto de cuantificación de oligonucleótidos

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  • eBook

Ebook de caracterización de oligonucleótidos

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  • Folleto

Folleto Soluciones de análisis de oligonucleótidos: Decisiones optimizadas para una calidad consistente

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  • Póster

Añadir la detección de masas rentable para mejorar la productividad en los ensayos de screening de oligonucleótidos

Añadir la detección de masas rentable para mejorar la productividad en los ensayos de screening de oligonucleótidos

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Las accesibles pero potentes soluciones de flujo de trabajo analítico de Waters traducen la complejidad en claridad, por lo que se puede acceder de manera eficiente a los conocimientos necesarios para llevar el producto desde la fase inicial a la fase de conformidad con la FDA, la EMA y mucho más.

Obtener más información sobre las soluciones de oligonucleótidos sintéticos.

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