Intercambio de hidrógeno y deuterio: Espectrometría de masas

Intercambio de hidrógeno y deuterio: Espectrometría de masas

Transforme sus procesos HDX manuales en una solución automatizada sin problemas con Waters. Descubra cómo los avances recientes en las tecnologías de LC-MS, automatización e informática han transformado el HDX-MS en una herramienta robusta para los estudios de estructuras de proteínas.

Transforme sus procesos HDX manuales en una solución automatizada sin problemas con Waters. Descubra cómo los avances recientes en las tecnologías de LC-MS, automatización e informática han transformado el HDX-MS en una herramienta robusta para los estudios de estructuras de proteínas.
Estructura de proteínas 3D
Protein structure 3D

Descripción general

En colaboración con Trajan, Waters ha transformado un proceso analítico altamente manual en un sistema integrado y automatizado con nuestro sistema HDX-MS, que aprovecha las separaciones UPLC de alta presión a nanoescala y microescala, la robótica de manipulación de muestras, y la espectrometría de masas por movilidad iónica de alta resolución para el análisis en profundidad de los estudios de la estructura de las proteínas, que incluyen:

  • Mapeo de epitopos
  • Unión proteína-fármaco
  • Las interacciones entre proteínas
  • Agregación
  • Efectos de la mutación en la conformación y la dinámica de las proteínas
  • Cambios conformacionales debidos a las formulaciones y a las pruebas de estabilidad

El sistema completo de Waters para estudios de MS HDX, disponible en el mercado, combina nuestro sistema ACQUITY UPLC M-Class con tecnología HDX con un espectrómetro de masas de Waters como SELECT SERIES Cyclic IMS, la robótica Trajan y el software específico de la aplicación HDX, DynamX.

Principios del intercambio de hidrógeno y deuterio

Principios del intercambio de hidrógeno y deuterio

La MS por intercambio de hidrógeno y deuterio (HDX) funciona en muchas aplicaciones, incluida la comprensión de cómo las terapias con moléculas pequeñas unen a las proteínas objetivo y la realización de mapeo de epitopos. Con esta tecnología, el deuterio en una solución reemplaza al hidrógeno de amida en la estructura de una biomolécula, y la MS mide estos cambios.

El hidrógeno de la amida en la estructura de una biomolécula se intercambia con deuterio en solución a diferentes velocidades que dependen en parte de la conformación. La MS puede medir estos cambios y, por lo tanto, deducir el grado de actividad en varios sitios. Estas ubicaciones se pueden identificar y asignar a la secuencia primaria, lo que permite una visualización más sencilla y revela información sobre la estructura de la proteína. El plegamiento relativo y la dinámica se pueden determinar a partir de las diferentes velocidades de absorción en diferentes ubicaciones.

Generar conjuntos de datos completos para todos los péptidos

Generar conjuntos de datos completos para todos los péptidos

Con UPLC-MSE, el laboratorio puede generar un conjunto de datos completo, midiendo todos los péptidos sin sesgo por la intensidad de la señal del péptido. Esta es una característica importante para los estudios HDX, en los que la información clave se puede encontrar en péptidos de baja intensidad.

HDX-MS abre nuevas ventanas en la dinámica de biomoléculas al proporcionar información sobre la absorción relativa de deuterio de diferentes conformaciones de una proteína, o ubicaciones dentro de una proteína. Los desarrollos recientes han convertido al HDX con espectrometría de masas en una herramienta más accesible para estudiar la dinámica de estructuras de orden superior (HOS) de productos bioterapéuticos. Las tendencias normativas y de la industria se han desplazado claramente para poner énfasis en la conformación y las relaciones entre las biomoléculas, lo que convierte a HDX en una herramienta clave que se está adoptando rápidamente en más áreas de análisis bioterapéutico.

Caracterización de productos biosimilares

Aprenda la manera en que las tecnologías LC-MS de Waters ayudan a quienes desarrollan productos biosimilares a conocer su estructura por completo y cómo varían respecto al producto innovador para así poder establecer sus especificaciones para sus productos biosimilares.

Aprenda la manera en que las tecnologías LC-MS de Waters ayudan a quienes desarrollan productos biosimilares a conocer su estructura por completo y cómo varían respecto al producto innovador para así poder establecer sus especificaciones para sus productos biosimilares.
Ver ahora
p38 MAP quinasa proteína, estructura química

Soluciones

Cuantifique con confianza los cambios en la conformación de proteínas

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Sistema ACQUITY UPLC M-Class con tecnología HDX

Aproveche las separaciones UPLC y la espectrometría de masas de alta resolución (HRMS) para identificar con confianza cambios en la conformación de proteínas con el sistema ACQUITY UPLC M-Class con tecnología HDX.

  • Structural Biology

Cobertura completa para una caracterización segura

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Xevo G3 QTof

Maximice la información de las muestras para los analitos, desde la caracterización detallada hasta la cuantificación exacta, con Xevo G3 QTof, que permite obtener resultados con total confianza.

 

  • Structural Biology

Máximo rendimiento y potencia. Redefina los límites de la ciencia.

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SELECT SERIES Cyclic IMS

Desarrollado mediante una colaboración específica, el SELECT SERIES Cyclic IMS combina la novedosa separación por movilidad iónica cíclica con la última generación de espectrometría de masas de tiempo de vuelo de alto rendimiento, lo que permite a los investigadores principales aprovechar al máximo su potencial en el campo de la investigación científica.

  • Structural Biology

Sin investigación, las decisiones se toman a ciegas

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Espectrómetro de masas de alta resolución SYNAPT XS

Logre la máxima flexibilidad y una mayor libertad de elección analítica para dar soporte a la creatividad científica y el éxito técnico para cualquier aplicación con SYNAPT XS.

  • Structural Biology

El software de Waters muestra convenientemente los resultados en vistas comparativas y reduce el tiempo de análisis con las capacidades automatizadas.

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Simplificar la interpretación del intercambio de hidrógeno y deuterio

Simplificar la interpretación del intercambio de hidrógeno y deuterio
Software de análisis de datos DynamX HDX

El software de análisis de datos DynamX HDX está diseñado para seleccionar sistemáticamente los espectros con criterios predeterminados y medir el cambio de masa de la forma deuterada. La automatización del software se ha simplificado considerablemente al utilizar los picos más nítidos y la mejor separación disponibles con UPLC, y la naturaleza completa de la detección por MSE.

  • Structural Biology

Waters ofrece una amplia gama de columnas con el potencial de superar los retos analíticos actuales.

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Digestión de proteínas en línea más rápida y eficiente

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Columna de pepsina Enzymate

Obtenga una digestión de proteínas en línea rápida, eficiente y reproducible con un tiempo de preparación de muestras menor gracias a la columna de pepsina Enzymate BEH.

  • Structural Biology

Patrones diseñados para verificar el rendimiento del sistema en los análisis de biomoléculas

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Patrones farmacéuticos y de ciencias de la vida

Genere resultados satisfactorios y añada un nivel adicional de garantía a las aplicaciones farmacéuticas y de ciencias de la vida esenciales con los patrones farmacéuticos y de ciencias de la vida de Waters.

  • Structural Biology

Consiga resultados exactos para varios flujos de trabajo de screening, confirmación y cuantificación forense con los servicios analíticos optimizados de Waters.

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Está a solo un clic de conseguir el éxito

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Waters Global Services

Optimice la productividad de su laboratorio a la vez que se ajusta a su presupuesto con Waters Global Services. Mantenga el máximo rendimiento del sistema, reduzca al máximo el tiempo de inactividad, supere los retos de aplicaciones científicas y cumpla con los estrictos requisitos de cumplimiento normativo.

  • Structural Biology

Haga que la ciencia sea más accesible con Waters Capital

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Soluciones de pago

Maximice los recursos de su laboratorio y reduzca al mínimo el riesgo con las opciones de pago de Waters Capital, que incluyen soluciones innovadoras para actualizar los instrumentos obsoletos, recibir soporte personalizado y contar con opciones flexibles para combinar la solución de laboratorio completa en un único y sencillo pago mensual: todo lo que necesita para avanzar en su actividad científica.

  • Structural Biology

Los datos hablan por sí solos

Los datos hablan por sí solos
Retención de deuterio para cuatro péptidos a partir de péptidos trípticos de enolasa de levadura.
Estructura cristalina de CaM codificada por colores para representar la captación de deuterio. Se compararon (A) Apo CaM y (B) holo CaM con marcaje de deuterio de 10 s. Se observó una diferencia significativa en la captación de deuterio en la región resaltada donde la conformación ha cambiado debido a la unión del calcio.
Se ha encontrado una absorción diferente de deuterio del mismo péptido en Apo y Holo CaM. A los 10 minutos de marcado, este péptido (FKEASLF, 12-19) mostró una mayor captación de deuterio en Apo (panel izquierdo) que en Holo (panel derecho).
Comparación de la pérdida de deuterio de la bradiquinina y la angiotensina II completamente deuteradas a A) diversas temperaturas de digestión, B) tiempos de mantenimiento de la extinción y C) flujo de digestión/desalación. La pérdida de deuterio causada por la fuente del espectrómetro de masas se resalta con un borde negro en 5B. Se encontraron perfiles de isótopos similares en ambos péptidos a presión normal y a presión alta (5D). La presión alta provocó una pérdida de deuterio ligeramente mayor (<5 %).

Aplicaciones

Comprender la relación entre la estructura y la función de las proteínas es fundamental para interpretar los mecanismos de la enfermedad. La espectrometría de masas de intercambio de hidrógeno y deuterio se ha convertido en una herramienta indispensable para interpretar la estructura de orden superior de las proteínas.

Comprender la relación entre la estructura y la función de las proteínas es fundamental para interpretar los mecanismos de la enfermedad. La espectrometría de masas de intercambio de hidrógeno y deuterio se ha convertido en una herramienta indispensable para interpretar la estructura de orden superior de las proteínas.

Notas de aplicación

Notas de aplicación

Seminarios web y recursos

  • Folleto

Folleto del sistema ACQUITY UPLC M-Class con flujo de trabajo con tecnología HDX

Folleto del sistema ACQUITY UPLC M-Class con flujo de trabajo con tecnología HDX
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  • Folleto

Software de análisis de datos DynamX HDX 3.0

Software de análisis de datos DynamX HDX 3.0
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  • Pósteres

Nuevas funciones en el software de bioinformática para el procesamiento automatizado de datos HDX MS

Nuevas funciones en el software de bioinformática para el procesamiento automatizado de datos HDX MS
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  • Pósteres

Sistema MS por intercambio de hidrógeno y deuterio (HDX MS) para investigar cambios conformacionales en la proteína calmodulina tras la unión del calcio

Sistema MS por intercambio de hidrógeno y deuterio (HDX MS) para investigar cambios conformacionales en la proteína calmodulina tras la unión del calcio
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Obtenga más información sobre las soluciones de espectrometría de masas por intercambio de hidrógeno y deuterio.

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