氫氘交換 - 質譜分析

氫氘交換 - 質譜分析

善用Waters技術,把人工處理的HDX流程,變成流暢無礙的自動化解決方案。瞭解最近頗有進展的LC-MS、自動化和資訊系統技術,如何將HDX-MS轉變成安定的蛋白質結構研究工具。

善用Waters技術,把人工處理的HDX流程,變成流暢無礙的自動化解決方案。瞭解最近頗有進展的LC-MS、自動化和資訊系統技術,如何將HDX-MS轉變成安定的蛋白質結構研究工具。

3D蛋白質結構
Protein structure 3D

概述

Waters與Trajan聯手合作,透過HDX-MS系統將高度人工處理的分析流程,轉變為整合式自動化系統,其使用奈米級至微米級的高壓UPLC分離、樣品處理機器人技術,以及高解析度離子遷移質譜分析,深入研究蛋白質結構,包括:

  • 表位定位
  • 蛋白質-藥物結合
  • 蛋白質與蛋白質的相互影響
  • 聚集
  • 突變對蛋白質構形和動力學的影響
  • 配方及穩定性試驗測試引起的構形變化

Waters在市面上推出的完整HDX-MS研究系統採用了ACQUITY UPLC M-Class/HDX聯用技術,搭配Waters質譜儀(例如SELECT SERIES Cyclic IMS)、Trajan機器人以及HDX特定應用軟體DynamX使用。



氫氘交換原理

氫氘交換原理

氫氘交換(HDX) MS適用於許多應用,可以瞭解小分子治療藥物如何與蛋白質標靶結合,還能執行表位定位。透過這項技術,用溶液中的氘取代生物分子主鏈中的醯胺氫,可讓MS量測出這些變化。

生物分子主鏈上的醯胺氫與溶液中的氘交換速率不同,部分取決於構形。MS可以量測出這些變化,進而推斷出不同位點的活性程度。這些位點經識別後可對映到一級結構,更容易顯像出來,並顯示出有關蛋白質結構的資訊。相對折疊和動力學的現象可以根據不同位點的不同吸收速率來測定。

為所有胜肽產生面面俱到的數據集

為所有胜肽產生面面俱到的數據集

有了UPLC-MSE,實驗室可以產生面面俱到的數據集,將所有胜肽量測出來,不會因胜肽訊號強度而有所偏頗。這是HDX研究中相當重要的功能,在低強度胜肽中也許能找出關鍵資訊。

HDX-MS能提供蛋白質不同構形或蛋白質內部位點的相對氘吸收量,為生物分子動力學開闢了新契機。近期發展頗多,使HDX-MS成為更容易使用的工具,方便研究生物治療藥物高階結構(HOS)動力學。產業和法規走向趨於明確,著重構形及生物分子之間的關係,讓HDX這項工具在生物治療藥物分析領域中快速受到廣泛採用。


生物仿製藥表徵分析

瞭解Waters LC-MS技術如何幫助生物仿製藥開發人員透徹瞭解創新藥的結構及變化,藉此為他們的生物仿製藥制定規格。

瞭解Waters LC-MS技術如何幫助生物仿製藥開發人員透徹瞭解創新藥的結構及變化,藉此為他們的生物仿製藥制定規格。


p38 MAP激酶蛋白質,化學結構

解決方案


定量分析蛋白質構形變化時更有信心

定量分析蛋白質構形變化時更有信心

借助採用HDX技術的ACQUITY UPLC M-Class系統,利用UPLC分離和高解析度質譜(HRMS),讓您識別蛋白質構形變化時更有信心。

  • Structural Biology

完整可信的特性分析

完整可信的特性分析

Xevo G3 QTof特性分析結果精闢入裡,提供最豐富的分析物樣品資訊,能幫助您準確定量,讓結果完全發揮可信度。

 

  • Structural Biology

極致能力,極致效能。重新定義科學的界限。

極致能力,極致效能。重新定義科學的界限。

SELECT SERIES Cyclic IMS緊密結合新穎的環狀離子遷移分離技術與先進的高效能飛行時間質譜儀,支援頂尖研究人員充分展現科學研發的潛力。

  • Structural Biology

沒有研發工作的協助,就必須在黑暗中摸索、做決策

沒有研發工作的協助,就必須在黑暗中摸索、做決策

SYNAPT XS能發揮一流的靈活性,且分析選擇更自由,能為任何應用促進科學創新及技術成功。

  • Structural Biology

Waters軟體提供方便的比較檢視結果,靠著自動化功能縮短分析時間。

Waters軟體提供方便的比較檢視結果,靠著自動化功能縮短分析時間。

氫氘交換解析也能變簡單

氫氘交換解析也能變簡單

DynamX HDX數據分析軟體旨在系統性地以預設標準選擇譜圖,並量測氘化形式的質量變化。搭配使用UPLC,訊號峰更鮮明、分離效果更好,再加上MSE偵測的面面俱到特性,可大大簡化軟體自動化作業。

  • Structural Biology

Waters提供各式各樣的管柱,能發揮潛力,克服眼前的分析難題。

Waters提供各式各樣的管柱,能發揮潛力,克服眼前的分析難題。

速度更快、效率更高的線上蛋白質酶解

速度更快、效率更高的線上蛋白質酶解

Enzymate BEH胃蛋白酶管柱能快速有效地在線上進行蛋白質酶解,樣品前處理時間更短,而且可以再現。

  • Structural Biology

用於驗證生物分子分析系統效能的標準品

用於驗證生物分子分析系統效能的標準品

運用Waters製藥與生命科學標準品促進成功,並為重要的製藥與生命科學應用提供多一層的保障。

  • Structural Biology

善用精簡的Waters分析服務,讓數項法醫毒物鑑證篩檢、確認及定量工作流程都能獲得準確的結果。

善用精簡的Waters分析服務,讓數項法醫毒物鑑證篩檢、確認及定量工作流程都能獲得準確的結果。

成功觸手可及

成功觸手可及

Waters全球服務幫助您達到實驗室最高生產力,同時解決預算問題。保持系統巔峰效能,徹底縮短停機時間、解決科學應用挑戰,並幫助通過嚴格的法規要求。

  • Structural Biology

Waters Capital讓科學變得平易近人

Waters Capital讓科學變得平易近人

Waters Capital提供多種付款選項,包括提供創新的解決方案來升級陳舊儀器,並提供客製化支援,整套實驗室解決方案綑綁在一個輕鬆的月付計畫中,發揮資源的最大效用,並將風險降到最低,讓您取得科學發展所需一切。

  • Structural Biology

數據不證自明

數據不證自明
來自酵母烯醇酶胰蛋白酶分解胜肽中四種胜肽的氘滯留性。
CaM的晶體結構,以顏色區分代表氘吸收量。(A) Apo CaM和(B) Holo CaM在10 s氘標記的情況比較。重點標示區可見氘吸收量出現顯著差異,其中的構形因鈣鍵結而有所變化。
在Apo和Holo CaM中發現相同勝肽的氘吸收量不同。標記10分鐘後,這種胜肽(FKEASLF, 12-19)在Apo(左圖)中的氘吸收量高於Holo(右圖)中的吸收量。
在A)各種分解溫度、B)淬熄保持時間和C)分解/去鹽流速下,全氘化緩激肽和血管收縮素II中氘損失的比較。由質譜儀離子源導致的氘損失在5B中以黑框重點標示。在常壓和高壓(5D)下,這兩種胜肽都出現相似的同位素圖譜。高壓會導致氘損失略高(<5%)。

應用焦點

瞭解蛋白質結構和功能之間的關係,是解讀疾病機制的根本。氫氘交換質譜分析已經成為解讀蛋白質高階結構不可或缺的工具。

瞭解蛋白質結構和功能之間的關係,是解讀疾病機制的根本。氫氘交換質譜分析已經成為解讀蛋白質高階結構不可或缺的工具。


應用手冊

應用手冊

網路研討會與資源



  • 產品型錄

ACQUITY UPLC M-Class/HDX聯用系統產品型錄

ACQUITY UPLC M-Class/HDX聯用系統產品型錄
  • 產品型錄

DynamX HDX數據分析軟體3.0

DynamX HDX數據分析軟體3.0
  • 海報

生物資訊學軟體中可自動處理HDX MS數據的新功能

生物資訊學軟體中可自動處理HDX MS數據的新功能
  • 海報

使用氫氘交換質譜(HDX MS)系統研究鈣結合後鈣調蛋白的構形變化

使用氫氘交換質譜(HDX MS)系統研究鈣結合後鈣調蛋白的構形變化


深入瞭解氫氘交換 - 質譜分析解決方案。

深入瞭解氫氘交換 - 質譜分析解決方案。

3D蛋白質結構
回到頁首 回到頁首