Progenesis QI
找出樣品中明顯改變的化合物
Progenesis QI軟體提供高度直覺的選單指引式工作流程,能讓您準確定量及鑑別樣品中明顯改變的化合物。Progenesis QI軟體有助於克服數據分析難題,讓您能夠快速、客觀且可靠地找出相關化合物,同時也可以輕鬆地匯出結果,以便進行後續質體學研究。
Progenesis QI不受儀器平台限制,並支援.mzML和.mzXML等通用格式。如需Progenesis QI詳細資訊,請造訪www.nonlinear.com。
概述
- 使用LipidBlast、ChemSpider、Elemental Composition、Metlin或Waters的搜尋方法MetaScope,靈活搜尋化合物數據
- 使用多種搜尋參數減少偽陽性鑑別結果:精確質量、MS/MS碎片、同位素分佈、RT及CCS
- 匯入鑑別結果,包括SDF數據庫的化學結構,以及指向化合物細節的內嵌式網路連結
- 快速找出明顯改變的化合物,例如變異數分析p值、倍數變化、冪
- 使用化合物豐度曲線圖顯現化合物相對豐度
- 使用全面的數據匯出選項,輕鬆地將結果整合到其他生物資訊學平台
- 查看和編輯用於化合物定量和鑑別的化合物加合物解捲積
建議用途:以LC-MS數據分析快速、客觀、可靠地找出目標化合物。
特色標題
簡化複雜數據的強大視覺化功能
Progenesis QI有個重要特色是,顯像清楚的數據圖,可讓使用者完全看懂數據,提高量測的可信度。利用2D方式呈現滯留時間、m/z與特性強度的離子強度圖,以及質譜與層析數據檢視,可在每一次執行時提供高品質的自動校準、訊號峰挑選及化合物加合物解捲積。
高準確度化合物定量
Progenesis QI能夠根據離子總強度提供精準的化合物量測結果。化合物加合物會自動解捲積,根據所有可用數據實現準確的定量。完成定量之後,可以鑑別各組中有統計上顯著豐度變化之化合物。可以研究來自多組的大量樣品,並在單一實驗中使用多種比較設計。結果可得出相關化合物的清單,供進一步表徵分析使用。
以多重搜尋參數進行可靠的化合物鑑別
Progenesis QI讓使用者不但能夠單純依據中性質量、同位素分佈及滯留時間搜尋化合物鑑別結果,還可以透過Waters最新Metascope搜尋引擎運用MS/MS碎片數據及碰撞截面(CCS)執行搜尋。這些額外的參數可以大幅提升資料庫搜尋的精準度,以及鑑別正確化合物的可能性。
更輕鬆地找出目標化合物
化合物鑑別仍然是小分子質體學實驗中主要的瓶頸之一,所以我們提供多種數據庫的運用,增加找出目標化合物的機會。靈活的化合物搜尋方法包括:
- 任何.SDF格式之資料庫
- .CSV格式的內設資料庫
- Metlin資料庫
- 皇家化學學會資料庫,採用ChemSpider外掛程式
- Lipidblast資料庫
- NIST MS和MS/MS資料庫
您也可以使用Progenesis QI所附之統計工具來找出目標化合物,包括:
- ANOVA
- 主成分分析(PCA)
- 階層聚集
同時也可使用經過EZInfo 3.0 (Umetrics)順暢整合的進階統計工具,取得監督分析和s-plot分析等功能。
減少瓶頸,簡化工作流程
Progenesis QI中的選單指引式工作流程能協助使用者完成軟體中的實驗步驟。如有必要,自動化程序可讓使用者順暢進行多個階段,大大提高隔夜及週末無人看守即自動處理數據的機會。有了Progenesis QI,您可以:
- 自動選擇及校準參考執行
- 自動挑選訊號峰及進行訊號歸一化(normalization)
- .CSV和.SPL檔案之自動化實驗設計
- 所有階段皆可自動化,直至化合物鑑別
想要簡化質體學研究的複雜程序,首先要先減少一長串研究數據解讀的瓶頸,觀察到的變化背後有哪些生物學機制?其中一個辦法就是生物途徑分析,可以徹底發揮質體學藥物研究數據的價值。Progenesis QI提供的匯出工具,可以輕鬆快速地和第三方途徑分析程式結合。