수소 중수소 교환 - 질량분석법

수소 중수소 교환 - 질량분석법

Waters와 함께, 수동 HDX 프로세스를 원활한 자동화 솔루션으로 전환할 수 있습니다. 최근의 LC-MS, 자동화 및 인포매틱스 기술의 발전이 HDX-MS를 어떤 방식으로 단백질 구조 연구를 위한 강력한 도구로 탈바꿈시키는지 알아보세요.

Waters와 함께, 수동 HDX 프로세스를 원활한 자동화 솔루션으로 전환할 수 있습니다. 최근의 LC-MS, 자동화 및 인포매틱스 기술의 발전이 HDX-MS를 어떤 방식으로 단백질 구조 연구를 위한 강력한 도구로 탈바꿈시키는지 알아보세요.
단백질 구조 3D
Protein structure 3D

개요

Trajan과의 협력을 통해 Waters는 다음과 같은 단백질 구조 연구의 심층 분석을 위해 고압 나노-마이크로 규모의 UPLC 분리, 샘플 처리 시스템 및 고분리능 이온 이동도 질량분석법을 활용하는 HDX-MS 시스템을 통해 수작업에 크게 의존하는 분석 프로세스를 통합 및 자동화 시스템으로 전환했습니다:

  • 에피토프 매핑
  • 단백질-약물 결합
  • 단백질 간의 상호 작용
  • 응집
  • 단백질 형태 및 역학에 미치는 변이의 영향
  • 형태 및 안정성 테스트로 인한 형태 변화

HDX-MS 연구를 위한 Waters의 종합 상용 시스템은 HDX 기술이 적용된 ACQUITY UPLC M-Class 시스템과 SELECT SERIES Cyclic IMS와 같은 Waters 질량분석기, Trajan 시스템 및 HDX 응용 분야별 소프트웨어인 DynamX가 결합되어 있습니다.

수소 중수소 교환의 원리

수소 중수소 교환의 원리

수소 중수소 교환(HDX) MS는 저분자 치료제가 단백질 표적에 결합되는 방식을 이해하고 에피토프 맵핑을 수행하는 등 다양한 응용 분야에서 활용됩니다. 이 기술을 사용하면 용액의 중수소가 생체분자의 백본에 있는 아미드 수소를 대체하고 MS가 이러한 변화를 측정합니다.

생체분자의 백본에 있는 아미드 수소는 형태에 따라 부분적으로 다른 속도로 용액 내 중수소와 교환됩니다. MS는 이러한 변화를 측정하여 다양한 부위의 활성도를 추론할 수 있습니다. 이러한 위치를 식별하고 기본 시퀀스에 매핑할 수 있으므로 시각화가 더 쉽고 단백질 구조에 대한 정보가 밝혀집니다. 상대적 접힘 및 역학은 다양한 위치에서의 다양한 흡수율로 측정할 수 있습니다.

모든 펩타이드에 대한 포괄적인 데이터 세트 생성

모든 펩타이드에 대한 포괄적인 데이터 세트 생성

실험실에서는 UPLC- MSE를 사용하여 포괄적인 데이터 세트를 생성함으로써 펩타이드 신호 강도에 따라 편향 없이 모든 펩타이드를 측정할 수 있습니다. 이는 핵심 정보가 낮은 강도의 펩타이드에서 발견될 수 있는 HDX 연구에서 중요합니다.

HDX-MS는 다양한 형태의 단백질 또는 단백질 내 위치에 따른 상대적 중수소 흡수에 대한 정보를 제공하여 생체분자 역학에 대한 새로운 창을 열어줍니다. 최근 개발에 힘입어 질량분석기가 포함된 HDX는 바이오치료제의 고차 구조(HOS) 역학 연구를 위한 도구로 접근하기가 더욱 쉬워졌습니다. 산업 및 규제 동향은 생체분자 간의 형태와 관계를 강조하는 방향으로 확실히 이동했으며, 이로 인해 HDX는 보다 많은 바이오치료제 분석 분야에서 빠르게 채택되는 핵심 도구가 되었습니다.

바이오시밀러 특성화 분석

바이오시밀러 개발자들이 Innovator 제품의 구조와 변형을 철저하게 이해하여 바이오시밀러 사양을 설정하는 데 Waters LC-MS 기술을 어떻게 활용하는지 알아보세요.

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p38 MAP 키나아제 단백질, 화학 구조

솔루션

높은 신뢰도로 단백질 구조의 변화 정량화

높은 신뢰도로 단백질 구조의 변화 정량화
HDX 기술을 갖춘 ACQUITY UPLC M-Class 시스템

HDX 기술을 갖춘 ACQUITY UPLC M-Class 시스템으로 UPLC 분리 및 고분리능 질량 분석(HRMS)을 수행하면 단백질 구조의 변화를 확실하게 식별할 수 있습니다.

  • Structural Biology

다양한 분석물질에 적용 가능한 신뢰성 있는 특성분석 지원

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Xevo G3 QTof

Xevo G3 QTof를 이용한 세부적인 특성분석으로부터 정확한 정량분석을 통해 분석물에 대한 샘플 정보를 최대한 확보함으로써 신뢰성 있는 결과를 제공합니다.

 

  • Structural Biology

강력한 파워, 극강의 성능. 과학의 경계를 새롭게 정의합니다

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SELECT SERIES Cyclic IMS

집중적인 협업을 통해 개발된 SELECT SERIES Cyclic IMS는 새로운 Cyclic Ion Mobility 분리와 첨단 고성능 ToF 질량분석 기술을 결합하여 선도적인 연구원들이 과학적 발견의 잠재력을 발휘할 수 있도록 합니다.

  • Structural Biology

과학적 발견이 없는 판단은 방향성을 잃게 됩니다

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SYNAPT XS 고분해능 질량분석기

궁극적인 유연성과 분석 선택의 여유를 더해주는 SYNAPT XS는 어떤 응용 분야에서든 과학적 독창성과 기술적 성공을 실현하는 발판이 됩니다.

  • Structural Biology

Waters 소프트웨어는 결과를 비교 보기로 편리하게 표시하고 자동화된 기능으로 분석 시간을 단축합니다.

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수소 중수소 교환 해석 간소화

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DynamX HDX Data Analysis Software

DynamX HDX Data Analysis Software는 사전 결정된 기준에 따라 스펙트럼을 체계적으로 선택하고 중수소화 형태의 질량 변화를 측정하도록 설계되었습니다. UPLC를 통해 제공되는 날카로운 피크와 개선된 분리, 그리고 MSE 검출의 포괄적인 특성을 활용하여 소프트웨어 자동화가 크게 단순화되었습니다.

  • Structural Biology

Waters는 현재의 분석 요구 그 이상을 충족하는 다양한 컬럼을 제공합니다.

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더 빠르고 효율적인 온라인 단백질 분해

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Enzymate Pepsin 컬럼

Enzymate BEH Pepsin 컬럼을 이용하여 샘플 전처리 시간을 줄이고, 신속하고 효율적이며 재현성 있는 온라인 단백질 분해를 달성하세요.

  • Structural Biology

생체분자 분석을 위한 시스템 성능 확인을 위해 설계된 표준물질

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제약 및 생명과학 표준물질

Waters 제약 및 생명과학 표준물질로 성공적인 결과를 도출해 보세요. 중요한 제약 및 생명과학 응용에서 보다 높은 신뢰도를 얻을 수 있습니다.

  • Structural Biology

간소화된 Waters 분석 서비스는 여러 법의학 스크리닝, 확증 및 정량 워크플로에서 정확한 결과를 제공합니다.

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한 번의 클릭으로 성공을 거머쥐세요

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Waters 글로벌 서비스

Waters 글로벌 서비스는 실험실 생산성을 높이는 동시에 저예산 문제를 해결해 줍니다. 시스템의 고성능을 유지하고 기기 가동 중단을 줄이며, 과학적인 응용 과제를 해결하고 규정을 엄격히 준수하도록 도와드립니다.

  • Structural Biology

Waters Capital로 과학이 더 친근해집니다

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결제 솔루션

노후화된 기기를 업그레이드하는 혁신적인 솔루션, 맞춤형 지원, 전체 실험실 솔루션 등 과학을 발전시키는 데 필요한 모든 것을 월간 결제로 간편하게 묶어 제공하는 Waters Capital의 유연한 결제 옵션을 통해 실험실 리소스를 충분히 활용하고 위험을 감소하세요.

  • Structural Biology

데이터는 그 자체로 의미가 있습니다

데이터는 그 자체로 의미가 있습니다
효모 에놀라제 트립신 펩타이드의 4개 펩타이드에 대한 중수소 머무름.
중수소 흡수를 나타내기 위해 색으로 구분된 CaM의 결정 구조. 10초 중수소 표지에서 (A) Apo CaM 및 (B) holo CaM을 비교했습니다. 칼슘 결합으로 인해 형태가 변경된 강조 표시된 영역에서 중수소 흡수에 상당한 차이가 관찰되었습니다.
Apo 및 Holo CaM에서 동일한 펩타이드의 다른 중수소 흡수가 관찰되었습니다. 10분 표지에서 이 펩타이드(FKEASLF, 12-19)는 Holo(오른쪽 패널)보다 Apo(왼쪽 패널)에서 더 높은 중수소 흡수를 나타냈습니다.
A) 다양한 분해 온도, B) 퀀치 유지 시간 및 C) 분해/탈염 유속에서 완전히 중수소화된 bradykinin과 angiotensin II의 중수소 손실 비교. 질량분석기 소스로 인한 중수소 손실은 5B에서 검정색 테두리로 강조 표시했습니다. 정상 압력 및 고압(5D) 조건에서 두 펩타이드 모두 동위원소 프로파일이 유사했습니다. 고압으로 인해 중수소 손실이 약간 높아졌습니다(5% 미만).

응용 분야

단백질 구조와 기능 사이의 관계를 이해하는 것은 병리학적 메커니즘을 해석하는 데 기본이 됩니다. 수소-중수소 교환 질량분석기는 단백질 고차 구조를 해석하는 데 필수적인 도구가 되었습니다.

단백질 구조와 기능 사이의 관계를 이해하는 것은 병리학적 메커니즘을 해석하는 데 기본이 됩니다. 수소-중수소 교환 질량분석기는 단백질 고차 구조를 해석하는 데 필수적인 도구가 되었습니다.

응용 자료

응용 자료

웹세미나 및 리소스

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HDX 기술을 갖춘 ACQUITY UPLC M-Class 시스템 브로셔

HDX 기술을 갖춘 ACQUITY UPLC M-Class 시스템 브로셔
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DynamX HDX Data Analysis Software 3.0

DynamX HDX Data Analysis Software 3.0
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  • 포스터

HDX MS 데이터의 자동화 처리를 위한 생물정보학 소프트웨어의 새로운 기능

HDX MS 데이터의 자동화 처리를 위한 생물정보학 소프트웨어의 새로운 기능
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  • 포스터

칼슘 결합 시 Calmodulin 단백질의 형태 변화를 탐구하기 위한 수소 중수소 교환 MS(HDX MS) 시스템

칼슘 결합 시 Calmodulin 단백질의 형태 변화를 탐구하기 위한 수소 중수소 교환 MS(HDX MS) 시스템
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수소 중수소 교환 – 질량분석 솔루션에 대해 자세히 알아보세요.

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단백질 구조 3D
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