氢氘交换 - 质谱分析

氢氘交换 - 质谱分析

沃特世可将您的手动HDX流程转变为无缝、自动化的解决方案。了解LC-MS、自动化和信息学技术的新进展如何将HDX-MS转变为稳定的蛋白质结构研究工具。

沃特世可将您的手动HDX流程转变为无缝、自动化的解决方案。了解LC-MS、自动化和信息学技术的新进展如何将HDX-MS转变为稳定的蛋白质结构研究工具。
3D蛋白质结构
Protein structure 3D

概述

沃特世携手Trajan，利用我们的HDX-MS系统成功将高度依赖人工操作的分析流程转变为使用集成化、自动化系统的流程，融合了高压纳升至微升级UPLC分离技术、样品处理机器人技术，以及高分辨率离子淌度质谱技术，可助力研究蛋白质结构的深度分析，包括：

  • 表位定位
  • 蛋白质-药物之间的结合
  • 蛋白质间相互作用
  • 聚集
  • 突变对蛋白质构象和动力学的影响
  • 配方和稳定性测试导致的构象变化

沃特世为HDX-MS研究打造的全套商用系统结合了沃特世的ACQUITY UPLC M-Class/HDX联用系统、沃特世质谱仪（例如SELECT SERIES Cyclic IMS）、Trajan机器人，以及HDX应用专用软件DynamX。

氢氘交换的基本原理

氢氘交换的基本原理

氢氘交换(HDX)质谱技术在很多应用中都能大显身手，包括研究小分子治疗药物如何与目标蛋白质结合，以及表位定位研究。这项技术用溶液中的氘原子替换生物分子主链中的酰胺氢原子，再通过质谱来测量这种变化。

生物分子主链中的酰胺氢原子与溶液中的氘原子发生交换的速率不同，这在一定程度上取决于构型。质谱仪可以测量这些变化，进而推断不同位点的活性。通过鉴别这些位点并将它们绘制到一级序列中，我们可以更轻松地实现可视化，揭示有关蛋白质结构的信息。相对折叠和动力学可由不同位点处的不同吸收速率确定。

生成所有肽的全面数据集

生成所有肽的全面数据集

借助UPLC-MSE技术，您可以测量所有肽而不受肽信号强度偏差的影响，生成十分全面的数据集。这对于HDX研究而言是相当重要的功能，因为低强度肽中可能隐藏着关键信息。

HDX-MS技术可以测定不同构型的蛋白质或蛋白质上不同位点的相对氘摄取量，为生物分子动力学研究开启了新的窗口。得益于近年来的技术进展，HDX-MS技术的可及性不断提升，已经成为研究生物治疗药物高级结构(HOS)动力学的重要工具。各个行业和监管机构显然越来越重视构象与生物分子之间的关系，这使得HDX作为一款关键工具迅速被生物治疗分析领域接纳并开始广泛应用。

生物类似药表征

了解沃特世LC-MS技术如何帮助生物类似药开发机构全面了解原研药的结构和变化，以便为生物类似药制定相应的规格。

了解沃特世LC-MS技术如何帮助生物类似药开发机构全面了解原研药的结构和变化，以便为生物类似药制定相应的规格。
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p38 MAP激酶蛋白质，化学结构

解决方案

信心十足地定量蛋白质构象变化

信心十足地定量蛋白质构象变化
采用ACQUITY UPLC M-Class系统的HDX平台

借助采用ACQUITY UPLC M-Class系统的HDX平台，利用UPLC分离和高分辨率质谱(HRMS)可靠地鉴定蛋白质的构象变化。

  • Structural Biology

兼具全面的覆盖范围和可靠的表征结果

兼具全面的覆盖范围和可靠的表征结果
Xevo G3 QTof

从详细表征到准确定量，Xevo G3 QTof能够执行全部检测任务，帮助用户尽可能从分析物中获取更多信息并对结果充满信心。

 

  • Structural Biology

强劲力量，性能非凡。重新定义科学界限。

强劲力量，性能非凡。重新定义科学界限。
SELECT SERIES Cyclic IMS

作为集思广益、通力合作的成果，SELECT SERIES Cyclic IMS融合了创新的环形离子淌度谱分离技术与前沿的高性能飞行时间质谱技术，可助力高水平科研人员在科学探索过程中解锁更多可能性。

  • Structural Biology

没有研究工作的协助，就必须在黑暗中摸索、决策

没有研究工作的协助，就必须在黑暗中摸索、决策
SYNAPT XS高分辨率质谱仪

SYNAPT XS能给您相当大的灵活性，让您更自由地选择分析方法，在任何应用中都能激发科学创造力，助力取得技术成果。

  • Structural Biology

沃特世软件能以比较视图简洁地显示结果，其自动化功能还有助于缩短分析时间。

沃特世软件能以比较视图简洁地显示结果，其自动化功能还有助于缩短分析时间。

简化氢氘交换分析的数据解析

简化氢氘交换分析的数据解析
DynamX HDX数据分析软件

DynamX HDX数据分析软件可按照预先确定的标准系统性地选择谱图，然后测量氘代形式化合物的质量变化。得益于UPLC峰形更清晰、分离度更高的优势，再结合MSE检测相当全面这一特点，软件的自动化程度得到了显著提升。

  • Structural Biology

沃特世提供多种色谱柱，有望解决您当前面临的分析挑战。

沃特世提供多种色谱柱，有望解决您当前面临的分析挑战。

更快速、更高效的在线蛋白质酶解

更快速、更高效的在线蛋白质酶解
Enzymate胃蛋白酶色谱柱

使用Enzymate BEH胃蛋白酶色谱柱，以更短的样品前处理时间实现快速、高效且可重现的在线蛋白质酶解。

  • Structural Biology

在生物分子分析中用于验证系统性能的各种标准品

在生物分子分析中用于验证系统性能的各种标准品
制药和生命科学标准品

利用沃特世制药和生命科学标准品助力成功，并为重要的制药和生命科学应用额外提供一层保障。

  • Structural Biology

使用精简的沃特世分析服务，在多种法医学筛查、确认和定量工作流程中获得准确结果。

使用精简的沃特世分析服务，在多种法医学筛查、确认和定量工作流程中获得准确结果。

成功触手可及

成功触手可及
沃特世全球服务

沃特世全球服务可以帮助您优化实验室工作生产率，同时满足预算要求。保持理想仪器性能、尽可能缩短停机时间、解决应用难题以及支持满足严格的法规要求。

  • Structural Biology

Waters Capital为科研助力

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支付解决方案

Waters Capital提供多种付款方式，包括针对仪器老化问题提供创新的升级解决方案，提供定制支持，还提供灵活的选项，只需简单绑定月度付款，即可获得完整的实验室解决方案，为您大幅增加实验室资源，同时大幅降低风险 - 在您推进科学研究的道路上满足您的一切需求。

  • Structural Biology

数据说明一切

数据说明一切
酵母烯醇酶胰蛋白酶解肽中四种肽的氘保留性
CaM的晶体结构，采用颜色编码表示氘摄取量。比较了10 s氘标记的(A) Apo CaM和(B) Holo CaM。在突出显示的区域中观察到显著的氘摄取量差异，该区域的构象因钙结合而发生了改变。
我们发现在Apo和Holo CaM中，同种一肽的氘摄取量有差别。标记10分钟后，Apo（左图）中这种肽（FKEASLF，12-19）的氘摄取量高于Holo（右图）。
全氘代缓激肽和血管紧张素II在A)不同酶解温度、B)不同淬灭保持时间，以及C)不同酶解/脱盐流速下的氘损失比较。图5B用黑框突出显示了质谱仪离子源引起的氘损失。这两种肽在常压和高压条件下的同位素谱图类似(5D)。高压导致的氘损失略高(<5%)。

应用

了解蛋白质结构与功能之间的关系是解读疾病机理的基础。氢-氘交换质谱已成为解析蛋白质高级结构不可或缺的工具。

了解蛋白质结构与功能之间的关系是解读疾病机理的基础。氢-氘交换质谱已成为解析蛋白质高级结构不可或缺的工具。

应用纪要

应用纪要

网络研讨会和资源

  • 产品手册

ACQUITY UPLC M-Class/HDX联用系统产品手册

ACQUITY UPLC M-Class/HDX联用系统产品手册
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  • 产品手册

DynamX HDX数据分析软件3.0

DynamX HDX数据分析软件3.0
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  • 海报

生物信息学软件中用于自动处理HDX MS数据的新功能

生物信息学软件中用于自动处理HDX MS数据的新功能
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  • 海报

使用氢氘交换质谱(HDX MS)系统研究钙结合后钙调蛋白的构象变化

使用氢氘交换质谱(HDX MS)系统研究钙结合后钙调蛋白的构象变化
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了解有关氢氘交换质谱解决方案的更多信息。

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3D蛋白质结构
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