Analyse des oligonucléotides de synthèse

Analyse des oligonucléotides de synthèse

De la préparation des échantillons à la séparation chromatographique, en passant par la détection optique et de masse, ainsi que par l’analyse des données conforme et la création de rapports, les outils de Waters adaptés à l’analyse des oligonucléotides offrent des performances et une productivité optimales. Les outils sont soutenus par nos équipes de Services Clients et d’assistance afin d’accélérer vos efforts de développement thérapeutique, diagnostique et de recherche.

De la préparation des échantillons à la séparation chromatographique, en passant par la détection optique et de masse, ainsi que par l’analyse des données conforme et la création de rapports, les outils de Waters adaptés à l’analyse des oligonucléotides offrent des performances et une productivité optimales. Les outils sont soutenus par nos équipes de Services Clients et d’assistance afin d’accélérer vos efforts de développement thérapeutique, diagnostique et de recherche.
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Présentation

La recrudescence de développement de thérapies à base d’oligonucléotides a conduit à l’apparition de pipelines en plein essor dans le secteur. Agissant au niveau de la transcription et de la traduction des gènes, ces médicaments à base d’acides nucléiques courts sont très prometteurs pour de nombreux troubles héréditaires et maladies courantes.

Les outils et techniques LC/MS de Waters jouent un rôle très important dans la confirmation de l’identité et de la pureté de ces médicaments, ainsi que dans la quantification de leur présence dans les biofluides.

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Applications

Dans le cas des thérapies à base d’oligonucléotides, la séquence et l’emplacement des nucléotides modifiés sont d’une importance essentielle pour leur fonction, leur stabilité et leur efficacité. La fragmentation LC/MS/MS est une technique clé qui permet d’obtenir ce niveau de confirmation des séquences et des outils automatisés d’analyse des données et de création de rapports facilitent le processus.

Dans le cas des thérapies à base d’oligonucléotides, la séquence et l’emplacement des nucléotides modifiés sont d’une importance essentielle pour leur fonction, leur stabilité et leur efficacité. La fragmentation LC/MS/MS est une technique clé qui permet d’obtenir ce niveau de confirmation des séquences et des outils automatisés d’analyse des données et de création de rapports facilitent le processus.

Notes d’application

Notes d’application

Les oligonucléotides de synthèse contiennent de nombreuses impuretés liées au processus et au produit, y compris des séquences de défaillance n-X tronquées, des variantes oxydées (p. ex.: conversions PS en PO) et désaminées, et pour les espèces d’ARN à double brin (p. ex.: petit ARN interférent), les composants simple brin sont considérés comme des impuretés. Pour les dépôts réglementaires, ces impuretés doivent être identifiées et bien caractérisées.

Les oligonucléotides de synthèse contiennent de nombreuses impuretés liées au processus et au produit, y compris des séquences de défaillance n-X tronquées, des variantes oxydées (p. ex.: conversions PS en PO) et désaminées, et pour les espèces d’ARN à double brin (p. ex.: petit ARN interférent), les composants simple brin sont considérés comme des impuretés. Pour les dépôts réglementaires, ces impuretés doivent être identifiées et bien caractérisées.

Notes d’application

Notes d’application

L’analyse quantitative des oligonucléotides à partir de biofluides nécessite des approches efficaces de préparation des échantillons afin d’obtenir un rendement maximal, une reproductibilité et des limites de détection inférieures. Les outils de préparation des échantillons, de chromatographie en phase liquide et de spectrométrie de masse de Waters sont conçus pour fournir la sensibilité, la reproductibilité et la productivité nécessaires à vos projets de bioanalyse d’oligonucléotides.

L’analyse quantitative des oligonucléotides à partir de biofluides nécessite des approches efficaces de préparation des échantillons afin d’obtenir un rendement maximal, une reproductibilité et des limites de détection inférieures. Les outils de préparation des échantillons, de chromatographie en phase liquide et de spectrométrie de masse de Waters sont conçus pour fournir la sensibilité, la reproductibilité et la productivité nécessaires à vos projets de bioanalyse d’oligonucléotides.

Notes d’application

Notes d’application

Étude de cas : BioSpring implémente les flux de travail LC/MS de Waters pour les oligonucléotides afin d’étendre la gamme existante

Découvrez comment BioSpring a utilisé le système conforme LC/MS BioAccord de Waters et le système Vion IMS Q-Tof avec water_connect afin de garantir l’intégrité des données, de prendre en charge des délais de traitement plus courts et de répondre aux exigences réglementaires dans le cadre de l’expansion de ses services de fabrication et d’analyse d’oligonucléotides.

Découvrez comment BioSpring a utilisé le système conforme LC/MS BioAccord de Waters et le système Vion IMS Q-Tof avec water_connect afin de garantir l’intégrité des données, de prendre en charge des délais de traitement plus courts et de répondre aux exigences réglementaires dans le cadre de l’expansion de ses services de fabrication et d’analyse d’oligonucléotides.
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Solutions

Les systèmes LC et LC/MS de Waters offrent des performances de séparation et une sensibilité de pointe pour l’analyse des oligonucléotides de synthèse.

Les systèmes LC et LC/MS de Waters offrent des performances de séparation et une sensibilité de pointe pour l’analyse des oligonucléotides de synthèse.

Adsorption ultra-faible pour une sensibilité et une reproductibilité maximales

Adsorption ultra-faible pour une sensibilité et une reproductibilité maximales
Solutions MaxPeak Premier

Les colonnes et les systèmes MaxPeak Premier éliminent le caractère imprévisible des pertes d’analytes en raison d’interactions métalliques, qui peuvent être particulièrement accentuées sur des oligonucléotides à charge négative.

  • Characterization
  • Impurities Analysis
  • Quantitative Analysis

Pour un suivi efficace des attributs produit tout au long du développement

Pour un suivi efficace des attributs produit tout au long du développement
Système LC/MS BioAccord avec ACQUITY Premier

Simplifiez l’analyse biopharmaceutique LC/MS haute performance pour chaque utilisateur grâce au système LC/MS BioAccord de Waters avec ACQUITY Premier, une plateforme intégrée et conforme qui peut être déployée de la découverte aux laboratoires GxP.

  • Characterization
  • Impurities Analysis
  • Quantitative Analysis

Couverture haute résolution complète pour une caractérisation fiable

Couverture haute résolution complète pour une caractérisation fiable
Spectromètre de masse Xevo G3 Q-Tof

Accélérez la caractérisation des oligonucléotides de synthèse avec le système de banc d’essai HRMS haute performance du spectromètre de masse Xevo G3 Q-Tof qui fournit des résultats qualitatifs et quantitatifs précis.

  • Characterization
  • Impurities Analysis
  • Quantitative Analysis

Sensibilité excellente pour les analyses de quantification

Sensibilité excellente pour les analyses de quantification
Spectrométrie de masse triple quadripolaire Xevo TQ Absolute

Élargissez le champ d’application de l’analyse de sensibilité optimale avec la spectrométrie de masse triple quadripolaire Xevo TQ Absolute de Waters, qui offre des niveaux inégalés de fiabilité, de reproductibilité et de performance pour vos applications d’oligonucléotides.

  • Quantitative Analysis

Le logiciel Waters simplifie l’acquisition et le traitement des données, ainsi que la communication des résultats d’analyse d’oligonucléotides.

Le logiciel Waters simplifie l’acquisition et le traitement des données, ainsi que la communication des résultats d’analyse d’oligonucléotides.

Analyse et traitement des données simplifiés

Analyse et traitement des données simplifiés
waters_connect pour produits biopharmaceutiques

Accélérez le passage de l’analyse d’échantillons à la prise de décision avec waters_connect pour l’analyse biopharmaceutique grâce à des applications pour l’analyse de masse intacte, la confirmation de séquence, la surveillance du processus et bien plus.

  • Quantitative Analysis
  • Impurities Analysis
  • Sequence and Modification Confirmation

Colonnes d’oligonucléotides, étalons et outils de préparation des échantillons spécialement conçus pour des performances et une productivité maximales.

Colonnes d’oligonucléotides, étalons et outils de préparation des échantillons spécialement conçus pour des performances et une productivité maximales.

Sensibilité améliorée avec un pH et une stabilité de la température inégalés

Sensibilité améliorée avec un pH et une stabilité de la température inégalés
Colonnes MaxPeak Premier BEH C18 pour l’analyse des oligonucléotides

Les colonnes en phase inverse MaxPeak Premier Oligonucleotide BEH C18 offrent une tolérance élevée au pH et à la température, une résolution exceptionnelle et une adsorption ultra-faible, ce qui améliore la sensibilité et la reproductibilité. Des tests de contrôle qualité spécifiques à l’analyte sur chaque lot de sorbants assurent la performance d’un lot à l’autre.

  • Impurities Analysis
  • Quantitative Analysis
  • Characterization

Kits d’extraction à rendement élevé pour l’analyse quantitative par LC/MS

Kits d’extraction à rendement élevé pour l’analyse quantitative par LC/MS
Kits et composants OligoWorks SPE

Obtenez un rendement jusqu’à deux fois plus élevé, un flux de travail simplifié, ainsi qu’une sensibilité et une reproductibilité LC/MS améliorée grâce aux kits et composants OligoWorks SPE pour l’extraction d’oligonucléotides thérapeutiques et de métabolites à partir de biofluides.

  • Quantitative Analysis

Analyse comparative des performances de la colonne et du système en toute confiance

Analyse comparative des performances de la colonne et du système en toute confiance
Étalons d’oligonucléotides/d’acides nucléiques

Éliminez le besoin de préparer des mélanges complexes grâce aux étalons d’oligonucléotides préemballés et certifiés de Waters, qui offrent une facilité d’utilisation et une tranquillité d’esprit lors d’opérations de séparation d’oligonucléotides.

  • Quantitative Analysis
  • Impurities Analysis
  • Characterization

Sélectivité orthogonale avec chromatographe sans paires d’ions

Sélectivité orthogonale avec chromatographe sans paires d’ions
Colonnes GTx pour thérapies géniques

La chromatographie à échange d’anions (AEX) et la chromatographie d’interaction hydrophile (HILIC) fournissent une sélectivité orthogonale et des options de LC sans paires d’ions. Waters propose des colonnes AEX faibles et fortes, ainsi que des colonnes BEH HILIC à liaison amide qui offrent une multitude de nouvelles options méthodologiques.

  • Quantitative Analysis
  • Impurities Analysis
  • Characterization

Gagnez en efficacité et en temps grâce à des solutions d’automatisation de laboratoire vérifiées

Gagnez en efficacité et en temps grâce à des solutions d’automatisation de laboratoire vérifiées

Amélioration de l’efficacité et du rendement de la préparation des échantillons

Amélioration de l’efficacité et du rendement de la préparation des échantillons
Automatisation et équipement de laboratoire

Simplifiez l’extraction d’oligonucléotides des biofluides pour les analyses LC/MS quantitatives grâce aux flux de travail vérifiés qui permettent de minimiser la variabilité, d’améliorer la traçabilité et de simplifier le transfert de méthode.

  • Quantitative Analysis
  • Impurities Analysis
  • Sequence and Modification Confirmation

La réussite à portée de clic

La réussite à portée de clic
Service Clients de Waters

Optimisez la productivité et la réussite de votre laboratoire avec les Services Clients de Waters. Maintenez les performances de pointe de votre système, réduisez les temps d’immobilisation, répondez à vos défis applicatifs et respectez les exigences de conformité les plus strictes.

  • Quantitative Analysis
  • Impurities Analysis
  • Sequence and Modification Confirmation

Rendez la science plus accessible grâce à Waters Capital

Rendez la science plus accessible grâce à Waters Capital
Solutions de paiement

Maximisez les ressources et minimisez les risques grâce aux options de paiement proposées par Waters Capital, notamment la mise à niveau des équipements vieillissants, une assistance personnalisée et le regroupement de l’ensemble de vos services en un seul forfait mensuel.

  • Quantitative Analysis
  • Impurities Analysis
  • Sequence and Modification Confirmation

Les données parlent d’elles-mêmes

Les données parlent d’elles-mêmes
Test de l’inertie du système UPLC ACQUITY Premier et de la colonne OST ACQUITY Premier à l’aide de l’oligomère 21-nt : chromatogramme UV de la concentration la plus faible détectable (0,5 nM ou 5 femtomoles de l’oligonucléotide 21-mers chargé sur colonne) comparée à l’injection de blanc précédente.
Courbes d’étalonnage du modulateur d’expression génique GEM91 utilisant une colonne en acier inoxydable et un système classique (rouge), une colonne ACQUITY Premier et un système classique (bleu), ainsi qu’une colonne et un système ACQUITY Premier (violet). Les différentes tendances indiquent des différences marquées dans la récupération à l’aide des colonnes et des systèmes testés.
Chromatogrammes TUV et TIC illustrant les performances du système BioAccord lorsque l’étalon OST de 1 μM a été dilué 100 fois (chargement d’un échantillon de 100 fmoles). Les cinq oligonucléotides principaux sont clairement détectés dans les chromatogrammes UV et TIC, ce qui indique que la sensibilité du système et de la méthode LC/MS est appropriée pour détecter les impuretés d’oligonucléotides de faible niveau.
La séquence de l’échelle complète LC/MS/MS a été confirmée pour la séquence de l’ARN simple brin de 5'-UCGUCAAGCGAUUACAAGGTT-3'. L’expérience a été réalisée à l’aide du pic M4 comme ion précurseur. L’attribution des pics de fragmentation a été réalisée en comparant les masses théoriques à l’aide de simples calculs dans un fichier Excel. MaxEnt3 a été utilisé pour la déconvolution des charges et le désisotopage.

Webinaires et ressources

  • Brochure

Quantification des oligonucléotides – Brochure

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  • eBook

Caractérisation des oligonucléotides – eBook

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  • Brochure

Dépliant « Solutions d’analyse des oligonucléotides : des décisions simplifiées pour une qualité constante »

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  • Poster

Ajout d’une détection de masse rentable pour améliorer la productivité des essais de criblage des oligonucléotides

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Documents associés

Produits pharmaceutiques et biopharmaceutiques
Avec les solutions de workflows analytiques de Waters, à la fois accessibles et performantes, toute opération, si complexe soit-elle, devient simple. Vous pouvez ainsi accéder efficacement aux connaissances nécessaires pour amener votre produit du point A au point FDA, EMA et au-delà.

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