Troca de hidrogênio/deutério – Espectrometria de massas

Troca de hidrogênio/deutério – Espectrometria de massas

Transforme seus processos manuais de HDX em uma solução automatizada perfeita com a Waters. Descubra como os recentes avanços em tecnologias de LC-MS, automação e análise de dados transformaram a HDX-MS em uma ferramenta robusta para estudos de estrutura de proteínas.

Transforme seus processos manuais de HDX em uma solução automatizada perfeita com a Waters. Descubra como os recentes avanços em tecnologias de LC-MS, automação e análise de dados transformaram a HDX-MS em uma ferramenta robusta para estudos de estrutura de proteínas.
Estrutura de proteínas em 3D
Protein structure 3D

Visão geral

Em parceria com a Trajan, a Waters transformou um processo analítico altamente manual em um sistema integrado e automatizado com nosso sistema HDX-MS, que utiliza separações por UPLC de alta pressão em nano a microescala, robótica de manuseio de amostras e espectrometria de massas com mobilidade iônica de alta resolução para análise aprofundada de estudos da estrutura de proteínas, incluindo:

  • Mapeamento de epítopos
  • Ligação fármaco-proteína
  • Interações proteína-proteína
  • Agregação
  • Efeitos da mutação na conformação e na dinâmica de proteínas
  • Alterações conformacionais devido a testes de estabilidade e formulações

O sistema completo da Waters disponível no mercado para estudos de HDX-MS combina nosso Sistema ACQUITY UPLC M-Class com tecnologia HDX com um espectrômetro de massas da Waters, como o SELECT SERIES Cyclic IMS, robótica da Trajan e um software específico a aplicações de HDX, o DynamX.

Os princípios da troca de hidrogênio/deutério

Os princípios da troca de hidrogênio/deutério

A MS (Espectrometria de massas) de troca de hidrogênio/deutério (HDX, Hydrogen Deuterium Exchange) funciona em muitas aplicações, incluindo o entendimento de como a terapêutica de moléculas pequenas se liga a alvos de proteína e a realização de mapeamento de epítopos. Com essa tecnologia, o deutério em uma solução substitui o hidrogênio de amida na estrutura de uma biomolécula, e a MS mede essas mudanças.

O hidrogênio de amida na estrutura de uma biomolécula troca com deutério em solução a taxas diferentes, parcialmente dependentes da conformação. A MS pode medir essas mudanças e, assim, pressupor o grau de atividade em vários sítios. Esses locais podem ser identificados e mapeados para a sequência primária, o que facilita a visualização e revela informações sobre a estrutura das proteínas. O enovelamento e a dinâmica relativos podem ser determinados a partir das diferentes taxas de absorção em diversos locais.

Gere conjuntos de dados abrangentes para todos os peptídeos

Gere conjuntos de dados abrangentes para todos os peptídeos

Com o UPLC-MSE, seu laboratório pode gerar um conjunto de dados abrangente, medindo todos os peptídeos sem desvios pela intensidade do sinal de peptídeos. Esse é um recurso importante para estudos de HDX, em que as principais informações podem ser encontradas em peptídeos de baixa intensidade.

O HDX-MS abre novas portas na dinâmica de biomoléculas fornecendo informações sobre a absorção relativa de deutério de diferentes conformações de uma proteína ou localizações dentro de uma proteína. Desenvolvimentos recentes tornaram o HDX com espectrometria de massas uma ferramenta mais acessível para estudar a dinâmica da estrutura de ordem superior (HOS, Higher Order Structure) de bioterapêuticos. As tendências regulatórias e do setor estão claramente indo em direção a uma ênfase na conformação e nas relações entre as biomoléculas, tornando o HDX uma ferramenta-chave que está sendo rapidamente adotada em mais áreas de análise bioterapêutica.

Caracterização de biossimilares

Saiba como as tecnologias de LC-MS da Waters ajudam desenvolvedores de biossimilares a compreender totalmente a estrutura e a variação do produto inovador para definir especificações de seus biossimilares.

Saiba como as tecnologias de LC-MS da Waters ajudam desenvolvedores de biossimilares a compreender totalmente a estrutura e a variação do produto inovador para definir especificações de seus biossimilares.
Visualizar agora
Proteína quinase p38 MAP, estrutura química

Soluções

Quantifique as alterações na conformação de proteínas com confiança

Quantifique as alterações na conformação de proteínas com confiança
Sistema ACQUITY UPLC M-Class com tecnologia HDX

Aproveite as separações por UPLC e a Espectrometria de Massas de alta resolução (HRMS, High-Resolution Mass Spectrometry) para identificar com segurança as alterações na conformação de proteínas com o Sistema ACQUITY UPLC M-Class com tecnologia HDX.

  • Structural Biology

Cobertura completa para oferecer uma caracterização confiável

Cobertura completa para oferecer uma caracterização confiável
Xevo G3 QTof

Maximize as informações das amostras para seus analitos, desde a caracterização detalhada até a quantificação exata com o Xevo G3 QTof, que proporciona total confiança em seus resultados.

 

  • Structural Biology

Potência máxima com desempenho insuperável. Redefina os limites da ciência.

Potência máxima com desempenho insuperável. Redefina os limites da ciência.
SELECT SERIES Cyclic IMS

Desenvolvido por meio de colaboração focada, o SELECT SERIES Cyclic IMS combina a inovadora separação por mobilidade iônica cíclica com espectrometria de massas de tempo de voo de alto desempenho de última geração, permitindo que os pesquisadores líderes desbloqueiem o potencial da descoberta científica.

  • Structural Biology

Sem descobertas, a tomada de decisão ocorre no escuro

Sem descobertas, a tomada de decisão ocorre no escuro
Espectrômetro de massas de alta resolução SYNAPT XS

Obtenha o máximo de flexibilidade e maior liberdade de escolha analítica para apoiar a criatividade científica e o sucesso técnico em qualquer aplicação com o SYNAPT XS.

  • Structural Biology

O software da Waters mostra de forma prática os resultados em exibições comparativas e reduz o tempo de análise com os recursos automatizados.

O software da Waters mostra de forma prática os resultados em exibições comparativas e reduz o tempo de análise com os recursos automatizados.

Simplificação da interpretação da troca de hidrogênio/deutério

Simplificação da interpretação da troca de hidrogênio/deutério
Software de análise de dados DynamX HDX

O software de análise de dados DynamX HDX foi projetado para selecionar espectros sistematicamente com critérios predeterminados e medir a mudança de massa da forma deuterada. A automação do software foi muito simplificada com a utilização dos picos mais finos e da melhor separação disponíveis com o UPLC, e da natureza abrangente da detecção por MSE.

  • Structural Biology

A Waters oferece uma ampla variedade de colunas com potencial para superar seus desafios analíticos atuais.

A Waters oferece uma ampla variedade de colunas com potencial para superar seus desafios analíticos atuais.

Digestão de proteínas on-line mais rápida e eficiente

Digestão de proteínas on-line mais rápida e eficiente
Coluna de pepsina Enzymate

Obtenha uma digestão de proteínas on-line rápida, eficiente e reprodutível com um tempo de preparo de amostras mais curto com a Coluna de pepsina Enzymate BEH.

  • Structural Biology

Padrões desenvolvidos para verificar o desempenho do sistema para análises de biomoléculas

Padrões desenvolvidos para verificar o desempenho do sistema para análises de biomoléculas
Padrões farmacêuticos e de ciências da vida

Gere resultados bem-sucedidos e adicione uma camada extra de garantia às aplicações farmacêuticas e de ciências da vida essenciais com os padrões farmacêuticos e de ciências da vida da Waters.

  • Structural Biology

Obtenha resultados exatos para diversas rotinas de trabalho de screening, confirmação e quantificação forenses utilizando os serviços analíticos simplificados da Waters.

Obtenha resultados exatos para diversas rotinas de trabalho de screening, confirmação e quantificação forenses utilizando os serviços analíticos simplificados da Waters.

Seu sucesso em um clique

Seu sucesso em um clique
Serviços Globais Waters

Otimize a produtividade do seu laboratório e, ao mesmo tempo, lide com suas realidades orçamentárias com os Serviços Globais Waters. Mantenha o desempenho máximo do sistema, reduza o tempo de inatividade, resolva desafios de aplicação científica e dê suporte a rigorosos requisitos de conformidade.

  • Structural Biology

Torne a ciência mais acessível com a Waters Capital

Torne a ciência mais acessível com a Waters Capital
Soluções de pagamento

Maximize seus recursos de laboratório e minimize os riscos com as opções de pagamento da Waters Capital, que inclui soluções inovadoras para a atualização de equipamentos antigos, suporte personalizado e opções flexíveis para agrupar toda a sua solução de laboratório em um pagamento mensal simples — tudo de que você precisa para avançar sua ciência.

  • Structural Biology

Os dados falam por si

Os dados falam por si
Retenção de deutério para quatro peptídeos a partir de peptídeos trípticos de enolase de levedura.
Estrutura cristalina de CaM (Calmodulina) codificada por cores para representar a absorção de deutério. (A) CaM (Calmodulina) na forma apo e (B) CaM na forma holo na marcação de deutério aos 10 s foram comparadas. Uma diferença significativa na absorção de deutério foi observada na região destacada em que a conformação foi alterada devido à ligação de cálcio.
Uma absorção diferente de deutério do mesmo peptídeo foi encontrada em CaM (Calmodulina) na forma apo e holo. Na marcação aos 10 minutos, este peptídeo (FKEASLF, 12-19) mostrou uma absorção de deutério maior na forma apo (painel da esquerda) do que na forma holo (painel da direita).
Comparação da perda de deutério a partir de bradicinina e angiotensina II totalmente deuteradas em A) várias temperaturas de digestão, B) tempos de espera de têmpera e C) taxa de fluxo de digestão/dessalinização. A perda de deutério causada pela fonte do espectrômetro de massas é destacada com uma borda preta em 5B. Perfis isotópicos semelhantes foram encontrados em ambos os peptídeos sob pressão normal e alta pressão (5D). A alta pressão causou uma perda de deutério um pouco maior (< 5%).

Aplicações

Entender a relação entre a estrutura e a função de uma proteína é fundamental para interpretar os mecanismos das doenças. A espectrometria de massas de troca de hidrogênio-deutério se tornou uma ferramenta imprescindível para interpretar a estrutura de ordem superior das proteínas.

Entender a relação entre a estrutura e a função de uma proteína é fundamental para interpretar os mecanismos das doenças. A espectrometria de massas de troca de hidrogênio-deutério se tornou uma ferramenta imprescindível para interpretar a estrutura de ordem superior das proteínas.

Notas de aplicação

Notas de aplicação

Webinars e recursos

  • Catálogos

Sistema ACQUITY UPLC M-Class com tecnologia HDX – Folheto

Sistema ACQUITY UPLC M-Class com tecnologia HDX – Folheto
Fazer download
  • Catálogos

Software de análise de dados DynamX HDX 3.0

Software de análise de dados DynamX HDX 3.0
Fazer download
  • Pôsteres

Novos recursos no software de bioinformática para processamento automatizado de dados de HDX-MS

Novos recursos no software de bioinformática para processamento automatizado de dados de HDX-MS
Fazer download
  • Pôsteres

Sistema de MS de troca de hidrogênio/deutério (HDX-MS) para investigação de alterações conformacionais na proteína de calmodulina após a ligação de cálcio

Sistema de MS de troca de hidrogênio/deutério (HDX-MS) para investigação de alterações conformacionais na proteína de calmodulina após a ligação de cálcio
Fazer download

Saiba mais sobre as soluções de espectrometria de massas de troca de hidrogênio/deutério.

Saiba mais sobre as soluções de espectrometria de massas de troca de hidrogênio/deutério.
Estrutura de proteínas em 3D
Voltar ao início Voltar ao início