Tripsina RapiZyme, calidad de espectrometría de masas (MS)
Logre una digestión de proteínas rápida, limpia y completa
Las digestiones de proteínas para la proteómica ascendente o el mapeo de péptidos en el sector biofarmacéutico están plagadas de largos tiempos de digestión y complejas compensaciones en el rendimiento. Equilibrar la velocidad y la finalización de la digestión, mientras se mantiene una alta reproducibilidad, pocos artefactos y una cobertura de secuencia completa, también es un desafío constante. Además, la productividad durante el análisis de datos a menudo se ve obstaculizada por mapas desordenados con varios picos no trípticos (rupturas de enlace omitidas, picos de autólisis, divisiones no específicas y picos no coincidentes). Esos numerosos picos pequeños e inesperados requieren una identificación que supone mucho tiempo, lo que ralentiza el trabajo crítico.
La tripsina de RapiZyme, calidad de espectrometría de masas (MS), permite una velocidad y una limpieza de la digestión sin concesiones gracias a su extraordinariamente alta resistencia a la autólisis, su alta pureza y su actividad mejorada. Al eliminar prácticamente la autólisis que afecta incluso a la tripsina más avanzada del mercado, la tripsina RapiZyme se puede utilizar en concentraciones comparativamente altas para lograr digestiones más rápidas sin tener que recurrir a altas temperaturas ni sacrificar la finalización de la digestión. En consecuencia, se mejora el tiempo de respuesta de las muestras, las operaciones del laboratorio y, lo que es más importante, se toman decisiones críticas con confianza y rapidez.
Especificaciones
Descripción general
- Logre digestiones eficientes de 30 minutos sin recurrir a altas temperaturas mediante el desbloqueo del uso de relaciones enzima-proteína (E-P) más altas con resistencia a la autólisis
- Realice análisis de datos más productivos mediante líneas base más limpias
- Logre una alta cobertura de secuencia para una caracterización e identificación fiables
- Alcance la reproducibilidad y la previsibilidad como tripsina de secuencia porcina expresada de manera recombinante y optimizada químicamente.
- Mejore la estabilidad, la recuperación del vial y la actividad tras la reconstitución para un rendimiento consistente mediante la liofilización con un excipiente compatible con LC-MS
- Robusta y flexible para su uso en diversos protocolos de mejora del flujo de trabajo
Uso recomendado: Para lograr digestiones mejoradas de proteínas para la proteómica ascendente o el mapeo de péptidos en el sector biofarmacéutico.
Cómo funciona RapiZyme
La tripsina RapiZyme es una tripsina recombinante químicamente optimizada. Debido a que no es de origen animal, está libre de quimotripsina contaminante, no requiere tratamiento con inhibidores de L-(tosilamido-2-fenil) etilclorometilcetona (TPCK) y, por lo tanto, está libre de problemas no específicos asociados a la digestión.
Digestiones rápidas
La metilación extensa y homogénea confiere a la tripsina RapiZyme una resistencia a la autólisis extraordinariamente alta. Esto permite el uso de la tripsina RapiZyme en relaciones E-P altas (por ejemplo, 1:5) para lograr digestiones completas en solo 30 minutos, sin tener que recurrir a temperaturas más altas. Con el uso de Remicade® como caso práctico, la tripsina RapiZyme produce picos de autólisis <0,1 % y una ruptura de enlace omitida <1 % (medida como % de la respuesta de TIC total). Una tripsina de un competidor líder en la industria proporciona un 6-7 % de picos de autólisis y un 4-5 % de ruptura de enlace omitida en las mismas condiciones.
Limpiar líneas base
Las decisiones críticas se toman reconociendo los cambios más pequeños en un mapa. Las agencias reguladoras exigen la identificación de cada pico. Los picos no coincidentes, los picos de artefactos, los picos de autólisis y los picos de ruptura de enlace omitidos son ruidos innecesarios y que requieren mucho tiempo. Requieren la revisión y el análisis científicos adicionales, lo que hace que los tiempos de procesamiento del software se disparen cuando se incluyen picos no trípticos o picos de autólisis de un modelo in silico de digestión de tripsina.
Con la tripsina RapiZyme, se puede proceder de forma rápida y segura con excelentes líneas base, sin ruido ni picos de artefactos. Todo con una digestión de 30 minutos.
Reproducibilidad y pureza: ¿Qué contiene la tripsina?
La tripsina RapiZyme recombinante (no derivada de animales) y homogéneamente metilada no contiene quimotripsina contaminante. Además, se liofiliza con un excipiente compatible con LC-MS para que la reconstitución sea fácil y predecible, y mejorar la recuperación del vial.
El resultado es una reproducibilidad excepcional, tanto de un lote a otro, como de una digestión a otra.
Flexible de usar
La tripsina RapiZyme puede hacer todo lo que se espera que haga la tripsina (en solución o inmovilizada) y mucho más. Con la tripsina RapiZyme, se puede:
- Eliminar la desalinización y mejorar la consistenciapara las aplicaciones de proteómica, bioprocesamiento y monitorización de MAM y PTM. La tripsina RapiZyme mantiene una alta actividad con cantidades moderadas de guanidina HCI
- Diluir guanidina HCI a 0,5-0,7 M y digerir en 2 horas en una relación enzima-proteína de 1:5 (pH 7,5)
- Controlar los artefactos para cualquier aplicación en la que se prefiera la digestión durante la noche sin comprometer la eficacia de la digestión
- Digerir durante la noche con una relación enzima-proteína de 1:100 a temperatura ambiente y pH 6,5
- Acelerar las digestiones tradicionales de relación enzima-proteína 1:20 a 1-3 horas para proporcionar flexibilidad adicional
- Calentar y eliminar la necesidad de enzimas inmovilizadas para simplificar o digerir las proteínas con RapiZyme térmicamente estable
- Digerir con una relación enzima-proteína 1:10 durante 1 hora a 70 °C