Proteómica de descubrimiento

Proteómica de descubrimiento

Detecte, identifique y mida con exactitud proteínas expresadas diferencialmente en estados patológicos y procesos biológicos, metabólicos y de señalización con las soluciones flexibles de proteómica de descubrimiento de Waters. Waters ayuda a los científicos a obtener resultados de alta calidad para comprender con seguridad el papel funcional de las proteínas como insumo en los proyectos translacionales de proteómica.

Detecte, identifique y mida con exactitud proteínas expresadas diferencialmente en estados patológicos y procesos biológicos, metabólicos y de señalización con las soluciones flexibles de proteómica de descubrimiento de Waters. Waters ayuda a los científicos a obtener resultados de alta calidad para comprender con seguridad el papel funcional de las proteínas como insumo en los proyectos translacionales de proteómica.

Descripción general

La proteómica de descubrimiento ayuda a los científicos a comprender las importantes funciones que desempeñan estas macromoléculas complejas. La identificación exacta de proteínas expresadas diferencialmente en estados patológicos puede traducirse potencialmente en biomarcadores funcionales. La proteómica también es un componente importante de los enfoques de biología de sistemas, y el análisis multiómico ayuda a validar los resultados para comprender mejor los procesos metabólicos y de señalización.

Para comprender con mayor exactitud el proteoma, Waters fue pionera en las estrategias de adquisición independiente de datos (DIA) para mejorar el análisis cuantitativo de los métodos de proteómica «ascendentes» no marcados, al tiempo que se generaban espectros de fragmentos de péptidos para todas las especies detectables. Con las tecnologías de espectrometría de masas de alta resolución, los sistemas de cromatografía de alta capacidad de picos, el software Progenesis y los métodos DIA de Waters, su laboratorio puede profundizar aún más en el proteoma.

Aplicaciones

La identificación exacta de las proteínas expresadas diferencialmente en estados patológicos puede traducirse potencialmente en biomarcadores funcionales, si se realizan los estudios de validación adecuados. Obtenga información sobre la experiencia de Waters en el descubrimiento de biomarcadores de proteínas con estas notas de aplicación.

La identificación exacta de las proteínas expresadas diferencialmente en estados patológicos puede traducirse potencialmente en biomarcadores funcionales, si se realizan los estudios de validación adecuados. Obtenga información sobre la experiencia de Waters en el descubrimiento de biomarcadores de proteínas con estas notas de aplicación.

Notas de aplicación

Documento técnico: Considerations for Selecting the Optimal Stationary Phases for Proteomic Trap-and-Elute Nanochromatography (Consideraciones para seleccionar las fases estacionarias óptimas para la nanocromatografía de trampa y elución de proteómica)

Comprenda la importancia de seleccionar una nanocolumna y una trampa relevantes al desarrollar un método nanoLC de trampa y elución. Este documento técnico aclara cómo las nanocolumnas y trampas de m/z nanoEase de Waters ofrecen una resolución cromatográfica insuperable, lo que permite una integración perfecta para compensar los análisis complejos en el laboratorio.

Comprenda la importancia de seleccionar una nanocolumna y una trampa relevantes al desarrollar un método nanoLC de trampa y elución. Este documento técnico aclara cómo las nanocolumnas y trampas de m/z nanoEase de Waters ofrecen una resolución cromatográfica insuperable, lo que permite una integración perfecta para compensar los análisis complejos en el laboratorio.
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Flujo de nebulización de partículas azules

Soluciones

Los sistemas LC-MS de Waters ofrecen un rendimiento absoluto en cuanto a separación y sensibilidad para los flujos de trabajo de proteómica de descubrimiento.

Máximo rendimiento y potencia. Redefina los límites de la ciencia.

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SELECT SERIES Cyclic IMS

Combine la novedosa separación por movilidad iónica cíclica con la vanguardista espectrometría de masas de tiempo de vuelo de alto rendimiento con SELECT SERIES Cyclic IMS para ampliar las ventajas de la movilidad iónica de rutina y lograr separaciones variables de alta resolución.

  • Protein Biomarker Discovery

Sin investigación, las decisiones se toman a ciegas.

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Espectrómetro de masas de alta resolución SYNAPT XS

Obtenga la máxima flexibilidad para apoyar la creatividad científica y el éxito técnico para aplicaciones de metabolómica de descubrimiento con SYNAPT XS, para un rendimiento analítico de vanguardia con SONAR y HDMSE con el fin de interrogar mezclas complejas.

  • Protein Biomarker Discovery

Deje que la entrada de LC haga el trabajo en las separaciones de nanoescala a microescala.

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Sistema ACQUITY M-Class

Obtenga la sensibilidad de la cromatografía líquida de micro y nanoflujo con la tecnología UPLC al equipar el laboratorio con el sistema ACQUITY UPLC M-Class, que ofrece la facilidad de uso de un sistema UPLC de escala analítica.

  • Protein Biomarker Discovery

Amplíe el rango dinámico de sus análisis con las separaciones en 2D.

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Sistema ACQUITY UPLC M-Class con tecnología 2D

Optimice el proceso de separación de LC en 2D con el sistema ACQUITY UPLC M-Class con tecnología 2D, que ofrece una configuración de métodos muy intuitiva basada en menús, químicas de separación estandarizadas y funcionamiento inteligente de la válvula para una mejor resolución cromatográfica de muestras proteómicas complejas.

  • Protein Biomarker Discovery

El software de Waters agiliza la adquisición, el procesamiento y la generación de informes de datos de los resultados de los análisis de proteómica de descubrimiento.

Descubra las proteínas que cambian en sus muestras

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Progenesis QI para proteómica

Detecte la presencia de proteínas en muestras complejas mediante el análisis label-free con Progenesis QI para proteómica de Waters. Evalúe la calidad de los datos de LC-MS con métricas de control de calidad (QC) aplicando flujos de trabajo guiados sumamente visuales.

  • Protein Biomarker Discovery

Consumibles de calidad para contribuir a su éxito. 

Mejore la calidad de las digestiones enzimáticas de proteínas en solución

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Surfactante RapiGest SF

Solucione los problemas de la compatibilidad con MS y de la digestión proteolítica prolongada con el surfactante RapiGest SF de Waters, lo que permite realizar digestiones en el mismo día y simplificar el análisis para mejorar radicalmente la eficacia de las pruebas.

  • Protein Biomarker Discovery

Compare y valide sus columnas de proteínas con facilidad 

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Patrones de proteínas

Realice análisis de proteínas de forma fácil y segura con los patrones de proteínas de Waters, previamente incluidos en viales de Waters, y permita la solubilización directa al mismo tiempo que se reducen al mínimo las discrepancias y la pérdida de muestra. 

  • Protein Biomarker Discovery

Genere separaciones de péptidos y proteínas de alta calidad

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Columnas de LC-MS de nano y microflujo

Genere separaciones de proteínas y péptidos de forma reproducible con nanocolumnas de proteínas y péptidos híbridas con puentes de etileno (BEH), híbridas con superficie cargada (CSH) y de sílice de alta resistencia (HSS) de Waters para separaciones altamente eficientes con un mayor número de identificaciones de picos.

  • Protein Biomarker Discovery

Está a solo un clic de conseguir el éxito

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Waters Global Services

Optimice la productividad y el éxito de su laboratorio con Waters Global Services para mantener el máximo rendimiento del sistema, minimizar el tiempo de inactividad, abordar los desafíos de las aplicaciones y cumplir con los estrictos requisitos de cumplimiento normativo.

  • Protein Biomarker Discovery

Haga que la ciencia sea más accesible con Waters Capital

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Soluciones de pago

Maximice los recursos y minimice el riesgo con las opciones de pago de Waters Capital, que incluyen la actualización de equipos obsoletos, la obtención de soporte personalizado y la combinación de servicios en un único pago mensual.

  • Protein Biomarker Discovery

Los datos hablan por sí solos

Los datos hablan por sí solos
Análisis estadístico multivariable de los datos proteómicos de alto rendimiento. El análisis de componentes principales no supervisado (A) muestra una clara separación entre los controles sanos y los sujetos con cáncer de mama. El mapa de calor correspondiente (B) resalta regiones claras de expresión diferencial de proteínas entre las dos cohortes. La infra y sobreexpresión de ApoA2 y LRG1, respectivamente, se proporcionan como ejemplos (C). Los diagramas de cajas y bigotes indican diferencias significativas y una conservación estricta de los datos dentro de cada grupo.
Los iones fragmento que se superponen en la escala m/z pero que muestran diferentes estados de carga (1+ y 2+) se pueden separar mediante IMS. Como se puede ver, el ion monocargado es mucho más pequeño en el espectro sin mejora de la banda ancha (WE). Cuando se utiliza WE, se pueden extraer iones de diferentes estados de carga, eliminando eficazmente las interferencias, y luego se pueden identificar con más seguridad en búsquedas posteriores en la base de datos.
Reproducibilidad de la cobertura de secuencia para 12 proteínas de E. coli. Se observan rutinariamente CV del 5 %.
Descripción general de las proteínas para las tres cohortes. El diagrama de Venn indica que la mayoría de las proteínas se superponen entre condiciones (A), mientras que los diagramas de cajas y bigotes muestran la reproducibilidad técnica de la técnica de SONAR en términos de %CV (B) y cobertura de secuencia de proteínas (C).

Seminarios web y recursos

  • Folleto

SELECT SERIES Cyclic IMS

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