Progenesis QI
Descubra los compuestos que cambian significativamente en sus muestras
El software Progenesis QI permite cuantificar e identificar con exactitud compuestos en las muestras que cambian significativamente, con compatibilidad con un flujo de trabajo guiado por menús altamente intuitivo. El software Progenesis QI ayuda a superar los desafíos del análisis de datos, lo que permite descubrir compuestos de interés de forma rápida, objetiva y fiable, y exportar resultados para aplicaciones de investigación ómica.
Progenesis QI no depende de la plataforma del instrumento, y admite formatos universales como .mzML y .mzXML. Para obtener más información acerca de Progenesis QI, consulte www.nonlinear.com.
Progenesis QI
Descripción general
- Busque datos de compuestos de forma flexible con LipidBlast, ChemSpider, Elemental Composition, Metlin o el método de búsqueda de Waters, MetaScope
- Reduzca los ID de falsos positivos mediante el uso de varios parámetros de búsqueda: masa exacta, fragmentos de MS/MS, distribución de isótopos, RT y CCS
- Importe los resultados de identificación, incluidas las estructuras químicas de las bases de datos SDF y los enlaces web integrados a los detalles del compuesto
- Encuentre rápidamente compuestos que cambian significativamente, p. ej., valor p de Anova, pliegues de cambio, potencia
- Visualice la abundancia relativa de compuestos utilizando gráficos de perfil de abundancia de compuestos
- Integre fácilmente los resultados con otras plataformas bioinformáticas con opciones integrales de exportación de datos
- Revise y edite la deconvolución de aductos de compuestos utilizada para cuantificar e identificar un compuesto.
Uso recomendado: Para descubrir de forma rápida, objetiva y fiable compuestos de interés en el análisis de datos de LC-MS.
Encabezado de características
Resolución de datos complejos con una potente visualización
Una de las funciones clave de Progenesis QI son las representaciones de datos sumamente atractivas y gráficas, que permiten a los usuarios visualizar y comprender por completo sus datos y, por tanto, le ofrecen una confianza adicional en las mediciones realizadas. Los mapas de intensidad iónica, que muestran una representación en 2D del tiempo de retención cromatográfico, los valores m/z y la intensidad característica, así como los espectros de masas y cromatogramas, proporcionan garantía de calidad de la alineación automática, la selección de picos y la deconvolución de aductos en cada muestra.
Cuantificación de compuestos con gran exactitud
Progenesis QI proporciona mediciones precisas y exactas de compuestos basadas en la suma de las intensidades iónicas. Los aductos de los compuestos se deconvolucionan automáticamente para proporcionar una cuantificación exacta a partir de todos los datos disponibles. Tras la cuantificación, es posible identificar los compuestos con cambios de abundancia estadísticamente significativos entre grupos. Se puede explorar un gran número de muestras de múltiples grupos, junto con diversos diseños de comparación, en un solo experimento. El resultado es una lista de compuestos de interés para una caracterización posterior.
Identificación fiable de compuestos con diversos parámetros de búsqueda
Progenesis QI permite a los usuarios identificar compuestos en base no solo a la masa neutra, la distribución isotópica y el tiempo de retención cromatográfico, sino también utilizando datos de fragmentos de MS/MS y mediciones de la sección transversal de colisión (CSS) mediante el nuevo motor de búsqueda Metascope de Waters. Las búsquedas realizadas en bases de datos con diversos parámetros mejoran considerablemente la especificidad de la búsqueda y aumentan la probabilidad de una identificación correcta de compuestos.
Encuentre compuestos de interés con mayor facilidad
La identificación de compuestos sigue siendo uno de los principales impedimentos de los experimentos ómicos de moléculas pequeñas; por tanto, proporcionamos acceso a una amplia variedad de bases de datos para aumentar las probabilidades de encontrar los compuestos de interés. Los métodos de búsqueda de compuestos flexibles incluyen:
- Cualquier base de datos en formato .SDF
- Bases de datos internas en formato .CSV
- Base de datos Metlin
- Bases de datos de la Royal Society of Chemistry con el complemento ChemSpider
- Base de datos de LipidBlast
- Bibliotecas de NIST para MS/MS y MS
También puede buscar compuestos de interés con las herramientas estadísticas que forman parte de Progenesis QI, entre las que se incluyen las siguientes:
- ANOVA
- Análisis de componentes principales (PCA)
- Análisis clúster jerárquico
También se pueden aprovechar las estadísticas avanzadas a través de la integración perfecta con EZInfo 3.0 (Umetrics) para acceder a funciones como el análisis supervisado y los gráficos s.
Reduzca los cuellos de botella y optimice los flujos de trabajo
El flujo de trabajo guiado por menús de Progenesis QI guía a los usuarios a través de los pasos experimentales del software. Si es necesario, las rutinas de automatización permiten a los usuarios avanzar sin dificultad por las diferentes etapas para maximizar las posibilidades de procesamiento de datos sin supervisión durante la noche y el fin de semana. Con Progenesis QI, obtendrá:
- Selección y alineación automáticas del análisis de referencia
- Normalización y selección automáticas de picos
- Diseño experimental automatizado a partir de archivos .CSV y .SPL
- Todas las etapas son automatizables hasta el momento de la identificación de compuestos
La simplificación de los experimentos ómicos comienza con la reducción del cuello de botella en la interpretación de la lista de descubrimientos: ¿cuál es la biología detrás de los cambios observados? Una forma de abordar esta pregunta y extraer el máximo valor de los datos de descubrimiento ómicos es Pathway Analysis. Progenesis QI incluye herramientas de exportación para interactuar de forma fácil y rápida con los programas de análisis de vías de terceros.
Recursos
Documentos
Asistencia
Siguientes pasos
