探索的プロテオミクス

探索的プロテオミクス

ウォーターズの柔軟な探索的プロテオミクスソリューションを使用することで、疾患状態、および生物学、代謝、シグナル伝達のプロセスで発現に差を示すタンパク質を正確に検出・同定・定量することができます。ウォーターズは、プロテオミクスの橋渡しパイプラインに資するタンパク質の機能的役割を確実に理解するために、質の高い結果を得られるように科学者を支援します。

ウォーターズの柔軟な探索的プロテオミクスソリューションを使用することで、疾患状態、および生物学、代謝、シグナル伝達のプロセスで発現に差を示すタンパク質を正確に検出・同定・定量することができます。ウォーターズは、プロテオミクスの橋渡しパイプラインに資するタンパク質の機能的役割を確実に理解するために、質の高い結果を得られるように科学者を支援します。

概要

探索的プロテオミクスは、これらの複雑な高分子が果たしている重要な機能的役割を科学者が理解するのに役立ちます。疾患状態で発現に差を示すタンパク質を正確に同定することにより、機能的バイオマーカーに橋渡しできる可能性があります。プロテオミクスは、システム生物学のアプローチの重要な構成要素でもあり、マルチオミクス分析は、結果をバリデーションして、代謝およびシグナル伝達のプロセスの理解をより深めるのに役立ちます。

ウォーターズは、プロテオームをより正確に理解するために、検出可能なすべての分子種についてペプチドフラグメントスペクトルを生成するとともに、「ボトムアップ」の非標識プロテオミクスメソッドの定量分析を改善するための、データインディペンデント取得（DIA）戦略を開発しました。ウォーターズの高分解能質量分析テクノロジー、ピークキャパシティーが高いクロマトグラフィーシステム、Progenesis ソフトウェア、DIA メソッドを使用することで、プロテオームをさらに深堀りして調べることができます。

アプリケーション

疾患状態で発現に差を示すタンパク質を正確に同定することにより、適切なバリデーション試験を行って、機能的バイオマーカーに橋渡しできる可能性があります。以下のアプリケーションノートでは、タンパク質バイオマーカーの探索に関するウォーターズの専門知識をご紹介します。

疾患状態で発現に差を示すタンパク質を正確に同定することにより、適切なバリデーション試験を行って、機能的バイオマーカーに橋渡しできる可能性があります。以下のアプリケーションノートでは、タンパク質バイオマーカーの探索に関するウォーターズの専門知識をご紹介します。

アプリケーションノート

ホワイトペーパー：プロテオミクストラップ溶出ナノクロマトグラフィー用の最適な固定相の選択に関する検討事項

トラップ溶出ナノ LC メソッドを開発する際に、関連するナノカラムとトラップを選択することの重要性について理解します。このホワイトペーパーでは、Waters nanoEase m/z ナノカラムおよびトラップにより、いかに優れたクロマトグラフィー分離が実現し、シームレスな統合が可能になってラボの分析の困難さが軽減するかについて説明します。

トラップ溶出ナノ LC メソッドを開発する際に、関連するナノカラムとトラップを選択することの重要性について理解します。このホワイトペーパーでは、Waters nanoEase m/z ナノカラムおよびトラップにより、いかに優れたクロマトグラフィー分離が実現し、シームレスな統合が可能になってラボの分析の困難さが軽減するかについて説明します。
ホワイトペーパーのダウンロード
青色の粒子のスプレー流

ソリューション

ウォーターズの LC-MS システムは、探索的プロテオミクスワークフローにおいて究極の分離能と感度を提供します。

究極のパワー、究極の性能で科学の限界に挑む

究極のパワー、究極の性能で科学の限界に挑む
SELECT SERIES Cyclic IMS

新規サイクリックイオンモビリティー分離と最先端の高性能飛行時間型質量分析を組み合わせた SELECT SERIES Cyclic IMS により、ルーチンイオンモビリティーのメリットが拡張し、さまざまな高分離能分離が実現します。

  • Protein Biomarker Discovery

ディスカバリーがなければ、暗闇の中で決定を行わなければなりません。

ディスカバリーがなければ、暗闇の中で決定を行わなければなりません。
SYNAPT XS 高分解能質量分析計

SYNAPT XS は、複雑な混合物を調査するための SONAR や HDMSE により最先端の分析性能を提供し、探索メタボロミクスアプリケーションにおける科学的創造性と技術的成功をサポートする究極の柔軟性が得られます。

  • Protein Biomarker Discovery

LC インレットにナノスケールからマイクロスケールまでの仕事を任せましょう。

LC インレットにナノスケールからマイクロスケールまでの仕事を任せましょう。
ACQUITY M-Class システム

ラボに ACQUITY UPLC M-Class システムを導入して、UPLC テクノロジーを使用することで、マイクロフローやナノフローの液体クロマトグラフィーの感度が実現し、分析スケールの UPLC システムが使いやすくなります。

  • Protein Biomarker Discovery

2D 分離による分析のダイナミックレンジの拡張。

2D 分離による分析のダイナミックレンジの拡張。
2D テクノロジー搭載 ACQUITY UPLC M-Class システム

2D テクノロジー搭載 ACQUITY UPLC M-Class システムを使用することで、2D-LC 分離プロセスが合理化し、メ非常に直観的なメニュー方式のメソッドのセットアップ、標準化された分離ケミストリー、複雑なプロテオミクスサンプルのクロマトグラフィー分離が向上するインテリジェントなバルブ操作が可能になります。

  • Protein Biomarker Discovery

ウォーターズのソフトウェアにより、探索的プロテオミクスの分析結果のデータ取り込み、解析、レポート作成が合理化します。

サンプル中で変化しているタンパク質を検出

サンプル中で変化しているタンパク質を検出
Progenesis QI for Proteomics

Waters Progenesis QI for Proteomics によるラベルフリー分析を使用して、複雑なサンプル中のタンパク質の存在を検出します。非常に視覚的なガイド付きの品質管理（QC）指標で LC-MS データの質を評価します。

  • Protein Biomarker Discovery

お客様の成功をサポートする高品質の消耗品。

溶液中のタンパク質の酵素消化の質を改善

溶液中のタンパク質の酵素消化の質を改善
RapiGest SF 界面活性剤

Waters RapiGest SF 界面活性剤を使用することで MS 適合性と時間のかかるタンパク質分解酵素消化の問題が解消し、同日の消化と分析の簡素化が可能になって、試験効率が大幅に向上します。

  • Protein Biomarker Discovery

タンパク質カラムの性能評価とバリデーションが容易に

タンパク質カラムの性能評価とバリデーションが容易に
タンパク質標準試料

ウォーターズのバイアルにパッケージ化されたウォーターズのタンパク質標準試料を使用して、タンパク質分析を簡単かつ確実に実行し、直接に可溶化できてサンプルのロスや不一致を最小限に抑えることができます。

  • Protein Biomarker Discovery

高品質のペプチドおよびタンパク質の分離を達成

高品質のペプチドおよびタンパク質の分離を達成
ナノおよびマイクロフロー LC-MS カラム

ウォーターズのエチレン架橋型ハイブリッド（BEH）、表面チャージハイブリッド（CSH）、およびハイストレングスシリカ（HSS）ペプチド・タンパク質ナノカラムにより、ペプチドおよびタンパク質の再現性のある分離が得られ、分離効率が向上し、同定できるピークの数が増加します。

  • Protein Biomarker Discovery

成功まであとワンクリック

成功まであとワンクリック
ウォーターズのグローバルサービス

Waters グローバルサービスを使用してラボの生産性と成功を最適化することで、最高のシステム性能を維持し、ダウンタイムを最小限に抑え、アプリケーションの課題に対処して、厳格なコンプライアンス要件に対応することができます。

  • Protein Biomarker Discovery

Waters Capital で科学へのアクセスを促進

Waters Capital で科学へのアクセスを促進
支払ソリューション

Waters Capital の支払いオプションを使用することで、リソースを最大化し、リスクを最小化することができます。これには、陳腐化した装置のアップグレード、カスタマイズされたサポートの利用、サービスを月 1 回の支払いにまとめるなどが含まれます。

  • Protein Biomarker Discovery

データがすべてを語る

データがすべてを語る
ハイスループットプロテオミクスデータの多変量統計解析。教師なし主成分分析（A）では、健常対照と乳がんの被験者が明確に分離していることがわかります。対応するヒートマップ（B）では、2 つのコホート間でタンパク質発現に差がある明確な領域が浮き彫りになっています。ApoA2 および LRG1 のそれぞれ発現低下と発現上昇を例（C）として示しています。箱ひげ図により、大きな差があること、および各グループ内ではデータがしっかり保存されていることがわかります。
m/z スケールでは重複しているが、異なるチャージ状態（1+ および 2+）を示すフラグメントイオンを、IMS で分離することができます。図からわかるように、1 価イオンの方が WE なしスペクトルではるかに小さくなっています。WE を使用すると、異なるチャージ状態のイオンを抽出して干渉を効果的に除去することができ、後続のデータベース検索での同定がより確実になります。
12 種の E. Coli タンパク質のシーケンスカバー率の再現性。5% CV がルーチンに見られます。
3 つのコホートにおけるタンパク質の概要。ベン図から、大半のタンパク質が条件間で重複していることがわかり（A）、箱ひげ図から、SONAR 手法の %CV（B）およびタンパク質のシーケンスカバー率（C）に関する技術的再現性がわかります。

Webinar およびリソース

  • ブローシャー

SELECT SERIES Cyclic IMS

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ウォーターズの探索的プロテオミクスの詳細情報はこちらから

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