蛋白质组学数据分析软件Progenesis QI
发现您的样品中变化显著的蛋白质
蛋白质组学数据分析软件Progenesis QI利用免标记分析的优势，可让您轻松定量和鉴定复杂样品中的蛋白质。蛋白质组学数据分析软件Progenesis QI是由沃特世子公司Nonlinear Dynamics开发的一款数据分析软件，它具有高度可视化的工作流程引导，使用多组实验设计，可让您快速、客观、可靠地从单个或部分样品中发现目标蛋白质。
除了常规的数据依赖分析(DDA)，蛋白质组学数据分析软件Progenesis QI还支持对沃特世MSE和HDMSE数据进行数据独立分析(DIA)。该软件还有一个独特之处，它可以利用离子淌度分离提供的额外分辨维度来提高鉴定和定量的准确度和精密度。蛋白质组学数据分析软件Progenesis QI不受仪器平台的限制，支持通用格式，例如.mzML和.mzXML。
蛋白质组学数据分析软件Progenesis QI
概述
- 使用质量控制(QC)指标评估LC-MS数据的质量
- 使用独有的共提取算法检测肽段离子，每次运行的峰提取始终如一，这对于精准定量至关重要
- 支持1D-和2D-LC，对分析中可进行比较的样品组、样品或实验数量没有限制
- 数据矩阵完整并且没有任何数值遗漏，实现可靠的多变量统计分析
- 使用通用搜索引擎的序列数据库检索能够自动合并肽段和肽段离子定性定量结果
- 完全兼容离子淌度技术，提供三个分辨维度
- 配合强大的数据可视化功能和工作流程引导，同时支持DDA和数据独立分析(DIA)，包括SONAR采集模式的数据
- 数据可轻松导出至Pathway Analysis工具，有助于加深对发现成果的生物学理解
推荐用途：利用免标记分析对复杂样品中的目标蛋白质进行定量和鉴定。
特色标题
免标记分析的优势
与标记技术相比，免标记LC‑MS技术体现出多种优势，包含以下方面：
- 减少蛋白质加样
- 没有标记试剂的花费
- 减少样品分离和样品处理
- 提高每个蛋白质的序列覆盖率
- 提高蛋白质组的总体覆盖率
- 能够在一次实验中对比更多的条件
对分析中维持统计功效的同时，不会牺牲任何数据
蛋白质组学数据分析软件Progenesis QI采用先定量再鉴定的方法，能够为您自动匹配每个样品的特征，并绘制出电子模拟综合映射图，包含整个样品组中的每个肽段。无论样品数量和重复次数有多少，该综合映射图都能持续检测和定量所有样品的特征，并创建未丢失任何值的数据矩阵。这意味着在对分析中维持统计功效的同时，不会牺牲具有潜在重要性的数据，也不需要进行数值代入。
使用QC指标评估LC-MS输入数据的质量
QC指标工具旨在防止您浪费宝贵的时间去分析不够优化的LC-MS数据，它包含诸多读数，例如LC峰宽、特征的动态范围、母离子质量数误差、漏切计数和每个蛋白质的肽段计数。此外，这些QC指标工具还可用于引导流程优化和故障排除。
在独特肽段和离子丰度的基础上可靠定量
蛋白质组学数据分析软件Progenesis QI以离子丰度为基础对肽段进行定量，其设置便于使用加标内标和由用户选择的"HiN"指标来估算绝对丰度。
蛋白质组学数据分析软件Progenesis QI还能够自动从搜索结果中结合肽段离子的定量和鉴定数据，如果需要，允许进行只以独特肽段为基础的蛋白质定量。
使用多种数据库搜索引擎进行蛋白质鉴定
蛋白质组学数据分析软件Progenesis QI具有高度灵活性，因为它可以使用多种由用户选择的搜索引擎搜索DIA和DDA数据。多次搜索的数据可合并用于一次实验。此外，如有需要，软件可选配ProteinLynx Global Server (PLGS)，便于分析沃特世MSE、HDMSE、DDA和HD-DDA数据。
引导的数据处理工作流程
蛋白质组学数据分析软件Progenesis QI具有菜单引导的工作流程，有助于引导您完成软件中的整个实验步骤。如有需要，自动化例程可令您无缝地经历多个阶段，以便尽量增加机会进行夜间和周末无人监管的数据处理操作。
- 数据导入
- 自动参考运行选择和匹配
- 自动峰提取和归一化
- 自动蛋白质定量
- 蛋白质数据库搜索
利用Pathway Analysis理解蛋白质差异
我们如何理解实验中的蛋白质差异？一种选择就是使用Pathway Analysis，确定数据中哪些生物路径有关联性，从而为生物情境化提供下一级信息。蛋白质组学数据分析软件Progenesis QI则更加高效，它提供的导出工具可快速轻松地与第三方Pathway Analysis程序对接，高效鉴定实验中的蛋白质差异。
