Oligonukleotid- und Nukleinsäurestandards

Oligonukleotidspezifische Analoge

Analytische LC-basierte Methoden können zu leistungsfähigen Werkzeugen für die Charakterisierung und Bestätigung der Qualität von Gentherapeutika werden, unabhängig davon, ob es sich um synthetische Oligonukleotide, mRNA oder vektorisierte Transgene handelt. Um eine Methode auf geeignete Weise zu implementieren, muss sie entwickelt, qualifiziert und dann auf Systemeignung überprüft werden. Qualitativ hochwertige Referenzmaterialien zur Hand zu haben, die den Analyten chemisch ähnlich sind, kann einen riesigen Unterschied machen.

Unser vielseitiger Katalog an Referenzstandards umfasst kleine interferierende RNA (siRNA), lipidkonjugierte Antisense-Oligonukleotide (C16-ASO), ssDNA 20-mer, ssDNA-Längenleitern und Single Guide RNA (sgRNA). Diese applikationsspezifischen Standards bieten sofort injizierbare Referenzen für die Methodenentwicklung, die intakte und die MS/MS-Fragmentierung sowie für Systemeignungstests.

Weiter hinauf auf der Chromatographieleiter

Verbinden Sie Ihre Trennung mit 15- bis 35-mer, 20- bis 60-mer und 20- bis 100-mer ssDNA-Leitern für die IPRP-, HILIC- und AEX-Analyse. Überprüfen Sie die Leistung Ihrer Assays auf Reinheit, Größenvarianten, Fehlersequenzen (N/N-1), Nukleotidmodifikationen und Rückgratvarianten. Bestätigen Sie, dass Ihre Pumpen präzise Gradienten liefern, überprüfen Sie die Selektivität Ihrer Adsorptions-Chromatographiesäule und kalibrieren Sie die größenbasierte Auflösungsleistung Ihrer Trennung.

Nutzen Sie SEC, AEX und RP für langkettige Nukleinsäuren

Nukleinsäure-Medikamente werden nicht kürzer. Da die LC-Methoden für noch größere Nukleinsäurespezies verbessert werden, werden neue Standards für Leistungsfähigkeit und Systemeignung benötigt. Die dsDNA-Leiter mit 50 bis 1350 bp ist für SEC-Chromatographie für große Poren zertifiziert und kann auch problemlos durch Anionenaustausch(AEX)- und nicht denaturierende Umkehrphasen-Chromatographie getestet werden. Die 17 Komponenten doppelsträngiger DNA (dsDNA) können als Referenzpunkt für die Größenkalibrierung, Systemeignung und Fehlersuche der Methode verwendet werden.

Überprüfen Sie Ihre Extraktionseffizienz

Um die Eigenschaften des Arzneimittelstoffwechsels und die pharmakokinetischen Eigenschaften (DMPK) von Antisense-Oligonukleotiden erfolgreich zu erkennen, müssen Analytiker robuste und effiziente Extraktionsverfahren festlegen. Die ASO-Konjugation mit Lipideinheiten verbessert den gezielten Transport in verschiedene Gewebe. Es hat sich jedoch herausgestellt, dass diese Funktion aus biologischen Matrices aufgrund der Schwierigkeiten bei der Löslichkeit und der extremen Proteinbindung von Natur aus schwer rückzugewinnen ist. Der lipidkonjugierte ASO-LC-MS-Standard von Waters ist mit einer C16-5'-Einheit konjugiert und enthält 2'-MOE-Modifizierungen und ein Phosphothioat-Rückgrat. Es ist ein Referenzmaterial mit hoher Unterscheidungskraft und kann verwendet werden, um die Rückgewinnung von synthetischen therapeutischen Oligonukleotiden zu bewerten. So kann die Entwicklung quantitativer Verfahren zur Probenvorbereitung sichergestellt werden, wie etwa die mit OligoWorks SPE gelieferten Protokolle.

Bestätigen Sie nicht denaturierende Analysen von Duplex-siRNA

Die Analyse von siRNA sowohl unter denaturierenden als auch nicht denaturierenden Bedingungen ermöglicht eine vollständige Charakterisierung von produktbedingten Verunreinigungen. Sowohl die IP-RP- als auch die HILIC-Methode können problemlos sowohl mit denaturierenden als auch mit nicht denaturierenden Bedingungen angewendet werden, um Reinheits- und Identitätsmessungen kleiner interferierender RNA (siRNA) zu unterstützen. Oberhalb von ca. 40 – 50 °C beginnen die meisten siRNA-Duplexe, in ihre individuellen Sense- und Antisense-Einzelstränge zu dissoziieren. Mit einem entsprechend entwickelten, nicht denaturierenden LC-Assay wird es möglich, die Duplexbildung zu erforschen und das Vorhandensein von überschüssigen nicht hybridisierten einzelsträngigen RNA(ssRNA)-Verunreinigungen zu quantifizieren. Der Waters siRNA-LC-MS-Standard kann ohne Weiteres zur Entwicklung und Qualifizierung dieser Assays verwendet werden.