Protéomique de découverte

Protéomique de découverte

Détectez, identifiez et mesurez avec exactitude les protéines exprimées de manière différentielle dans les états pathologiques et les processus biologiques, métaboliques et de signalisation grâce aux solutions flexibles de protéomique de découverte de Waters. Waters aide les scientifiques à obtenir des résultats de haute qualité pour bien comprendre le rôle fonctionnel des protéines et ainsi alimenter le pipeline protéomique translationnel.

Détectez, identifiez et mesurez avec exactitude les protéines exprimées de manière différentielle dans les états pathologiques et les processus biologiques, métaboliques et de signalisation grâce aux solutions flexibles de protéomique de découverte de Waters. Waters aide les scientifiques à obtenir des résultats de haute qualité pour bien comprendre le rôle fonctionnel des protéines et ainsi alimenter le pipeline protéomique translationnel.

Présentation

La protéomique de découverte aide les scientifiques à comprendre les fonctions importantes de ces macromolécules complexes. L’identification précise de protéines qui s’expriment différemment selon l’état de la maladie peut déboucher sur la découverte de biomarqueurs fonctionnels. La protéomique est également une composante importante des approches fondées sur la biologie des systèmes, tandis que l’analyse multi-omique apporte une validation des découvertes afin de mieux comprendre les processus métaboliques et de signalisation.

Pour mieux comprendre le protéome, Waters a mis au point des stratégies d’acquisition indépendante des données (DIA) visant à améliorer l’analyse quantitative des méthodes protéomiques sans marquage de type « bottom-up » tout en générant des spectres de fragments peptidiques pour toutes les espèces détectables. Grâce à ses technologies de spectrométrie de masse à haute résolution, ses systèmes de chromatographie à haute capacité de pics, son logiciel Progenesis et ses méthodes DIA, Waters permet à votre laboratoire d’aller encore plus loin dans l’étude du protéome.

Applications

L’identification précise de protéines qui s’expriment différemment selon l’état de la maladie peut déboucher sur la découverte de biomarqueurs fonctionnels, à condition que des études de validation appropriées soient menées. Avec ces notes d’application, découvrez l’expertise de Waters en matière de recherche de biomarqueurs protéiques.

L’identification précise de protéines qui s’expriment différemment selon l’état de la maladie peut déboucher sur la découverte de biomarqueurs fonctionnels, à condition que des études de validation appropriées soient menées. Avec ces notes d’application, découvrez l’expertise de Waters en matière de recherche de biomarqueurs protéiques.

Notes d’application

Livre blanc : Considérations pour la sélection des phases stationnaires optimales pour la nanochromatographie de piégeage et d’élution en protéomique

Découvrez pourquoi il est important de choisir une nanocolonne et un piège appropriés pour le développement d’une méthode nanoLC avec piège et élution. Ce livre blanc explique comment les nanocolonnes et pièges nanoEase m/z de Waters permettent d’obtenir une résolution chromatographique inégalée, ce qui permet une intégration transparente et simplifie les analyses complexes en laboratoire.

Découvrez pourquoi il est important de choisir une nanocolonne et un piège appropriés pour le développement d’une méthode nanoLC avec piège et élution. Ce livre blanc explique comment les nanocolonnes et pièges nanoEase m/z de Waters permettent d’obtenir une résolution chromatographique inégalée, ce qui permet une intégration transparente et simplifie les analyses complexes en laboratoire.
Télécharger le livre blanc
Spray de particules bleues

Solutions

Les systèmes LC/MS de Waters offrent des performances absolues en matière de séparation et de sensibilité pour les workflows de protéomique de découverte.

Puissance ultime, performance ultime. Repoussez les limites de la science.

Puissance ultime, performance ultime. Repoussez les limites de la science.
Spectromètre de masse SELECT SERIES Cyclic IMS

Grâce au spectromètre de masse SELECT SERIES Cyclic IMS, associez la technologie innovante de séparation par mobilité ionique cyclique aux performances de pointe de la spectrométrie de masse à temps de vol pour étendre les bénéfices de la mobilité ionique de routine et réaliser des séparations hautement résolutives flexibles.

  • Protein Biomarker Discovery

Sans outils d’investigation, impossible de prendre des décisions éclairées .

Sans outils d’investigation, impossible de prendre des décisions éclairées .
Spectromètre de masse hautement résolutif SYNAPT XS

Avec le spectromètre de masse SYNAPT XS, bénéficiez d’une flexibilité optimale qui facilite la créativité scientifique et la réussite technique pour les applications de métabolomique de découverte. Obtenez des performances analytiques de pointe grâce aux technologies SONAR et HDMSE.

  • Protein Biomarker Discovery

Laissez votre entrée LC faire le travail pour vos séparations allant de l’échelle nano à l’échelle micro

Laissez votre entrée LC faire le travail pour vos séparations allant de l’échelle nano à l’échelle micro
Système ACQUITY M-Class

Bénéficiez de la sensibilité de la chromatographie liquide MicroFlow et NanoFlow grâce à la technologie UPLC en équipant votre laboratoire du système ACQUITY UPLC M-Class, qui offre la facilité d’utilisation d’un système UPLC à l’échelle analytique.

  • Protein Biomarker Discovery

Élargissez la gamme dynamique de votre analyse avec des séparations 2D.

Élargissez la gamme dynamique de votre analyse avec des séparations 2D.
Système ACQUITY UPLC M-Class avec technologie 2D

Simplifiez le procédé de séparation LC 2D grâce au système ACQUITY UPLC M-Class avec technologie 2D. Il offre une configuration de méthode pilotée par un menu très intuitif, des chimies de séparation standardisées et un fonctionnement intelligent des vannes pour une meilleure résolution chromatographique des échantillons protéomiques complexes.

  • Protein Biomarker Discovery

Le logiciel Waters simplifie l’acquisition et le traitement des données, ainsi que la communication des résultats d’analyse de protéomique de découverte.

Repérez les protéines qui varient dans vos échantillons

Repérez les protéines qui varient dans vos échantillons
Progenesis QI for Proteomics

Détectez la présence de protéines dans vos échantillons complexes par une analyse sans marquage via le logiciel Progenesis QI for Proteomics de Waters. Évaluez la qualité de vos données LC/MS grâce aux indicateurs de contrôle qualité (QC) et aux workflows guidés très visuels.

  • Protein Biomarker Discovery

Des consommables de qualité pour des analyses réussies 

Améliorez la qualité des digestions enzymatiques des protéines en solution

Améliorez la qualité des digestions enzymatiques des protéines en solution
Tensioactif RapiGest SF

Le tensioactif RapiGest SF de Waters permet de surmonter les problèmes de compatibilité MS et les longues digestions protéolytiques. Il permet de réaliser des digestions dans la journée et de simplifier l’analyse pour une efficacité nettement accrue des tests.

  • Protein Biomarker Discovery

Créez un point de référence des performances de vos colonnes pour protéines et validez-les en toute simplicité 

Créez un point de référence des performances de vos colonnes pour protéines et validez-les en toute simplicité 
Étalons de protéines

Réalisez vos analyses de protéines avec facilité et confiance grâce aux étalons de protéines de Waters. Préconditionnés dans des flacons de Waters, ils permettent une solubilisation directe tout en réduisant les pertes d’échantillons et les écarts. 

  • Protein Biomarker Discovery

Séparations de haute qualité pour les peptides et les protéines

Séparations de haute qualité pour les peptides et les protéines
Colonnes LC/MS NanoFlow et MicroFlow

Réalisez de manière reproductible des séparations de peptides et de protéines à l’aide des colonnes NanoFlow à particules hybrides à pont éthane (BEH), à particules hybrides chargées en surface (CSH) et à particules de silice haute résistance (HSS) de Waters pour les peptides et les protéines. Bénéficiez ainsi de séparations hautement efficaces avec davantage de pics identifiés.

  • Protein Biomarker Discovery

La réussite à portée de clic

La réussite à portée de clic
Service Clients de Waters

Optimisez la productivité et le succès de votre laboratoire avec Waters Global Services, pour maintenir une performance optimale des systèmes, minimiser les temps d’immobilisation, prendre en charge les applications les plus complexes et répondre aux strictes exigences de conformité.

  • Protein Biomarker Discovery

Rendez la science plus accessible grâce à Waters Capital

Rendez la science plus accessible grâce à Waters Capital
Solutions de paiement

Maximisez les ressources et minimisez les risques grâce aux options de paiement proposées par Waters Capital, notamment la mise à niveau des équipements vieillissants, une assistance personnalisée et le regroupement de l’ensemble de vos services en un seul forfait mensuel.

  • Protein Biomarker Discovery

Les données parlent d’elles-mêmes

Les données parlent d’elles-mêmes
Analyse statistique multivariée de données protéomiques à haute cadence. L’analyse en composantes principales non supervisée (A) montre une séparation nette entre les sujets témoins sains et les sujets atteints de cancer du sein. La carte thermique correspondante (B) met en évidence des régions claires d’expression protéique différentielle entre les deux cohortes. La sous-expression d’ApoA2 et la surexpression de LRG1 sont données à titre d’exemple (C). Les diagrammes en boîte à moustaches révèlent des différences significatives et une forte homogénéité des données au sein de chaque groupe.
Les ions fragments qui se chevauchent sur la gamme m/z mais qui présentent des états de charge différents (1+ et 2+) peuvent être séparés par IMS. Comme on peut le voir, l’ion à charge simple est beaucoup plus petit dans le spectre sans électrode WE. L’utilisation d’une électrode WE permet d’extraire les ions ayant des états de charge différents, ce qui élimine efficacement les interférences, et de les identifier avec plus de confiance lors des recherches ultérieures dans les bases de données.
Reproductibilité de la couverture de séquence pour 12 protéines E. coli. On observe une variation de 5 % en routine.
Vue d’ensemble des protéines pour les trois cohortes. Le diagramme de Venn indique que la plupart des protéines se recoupent entre les différents groupes (A), tandis que les diagrammes en boîte à moustaches montrent la reproductibilité technique de la technique SONAR en termes de coefficient de variation (B) et de couverture de la séquence protéique (C).

Webinaires et ressources

  • Brochure

Spectromètre de masse SELECT SERIES Cyclic IMS

Spectromètre de masse SELECT SERIES Cyclic IMS
Télécharger

Découvrez-en davantage sur les solutions de Waters pour la protéomique de découverte.

Découvrez-en davantage sur les solutions de Waters pour la protéomique de découverte.
Haut de la page Haut de la page