需要改善LC/MS代谢组学的数据库评分?试试ACQUITY Premier色谱柱


在又一次错误的任务之后,我知道必须有一个更好的方法来改善我的数据库匹配!"。光谱库匹配是非靶向或高分辨率质谱分析(如尿液或血浆代谢组学)工作流程中的一个组成部分。对非疾病和疾病状态的样本进行比较,可以深入了解对疾病进展有重要意义的潜在生物途径。然后,科学家们能够把重点放在这些领域,以获得潜在的新疗法和/或诊断测试。然而,为了确定这些代谢物,我们要对我们的数据进行数据库搜索。有几个商业数据库可供购买;一些有策划的光谱,另一些则是在软件内进行理论碎裂的结构。库匹配的一个重要因素是你的分析所匹配的数据的质量。相对于参考文献来说,峰数太少或太多都会对你的分数产生负面影响。对不正确的分配的影响意味着你可能在错误的树上吠叫而错过了一个关键的线索。

让我们来看看柠檬酸。它作为三羧酸(TCA)循环的一部分存在于细胞中。柠檬酸因与金属互动而闻名,最明显的是铁。系统中铁的存在会导致分析物的损失或质谱中的加合物,从而产生问题。使用ACQUITY PREMIER色谱柱,我们能够减轻这些化合物与金属的相互作用。图1显示了用标准硬件的色谱柱(顶部)和用ACQUITY Premier色谱柱硬件的色谱柱(底部)分析稀释的人类尿液样品中的柠檬酸的高能(或碎片)光谱。我们立即看到了光谱的不同,ACQUITY Premier色谱柱呈现的光谱更清晰,更不复杂。值得注意的是,使用Acuity Premier色谱柱,我们看到已知的Fe-Citrate复合物(435.9m/z[1])的含量要少得多。 在搜索光谱库时,这将转化为更高的碎片分数(图2),当然也使你在实验室中的生活更容易。.

诸如这些具有挑战性的分析,使得改用ACQUITY Premier色谱柱成为不二之选。

参考文献。

Silva Aet al. Dalton Transactions.2009(40), 8616-8625

 

人体尿液中柠檬酸在标准CSH苯基-己基柱(上)和CSH苯基-己基ACQUITY Premier柱(下)上的碎片光谱实例

或。

人体尿液中柠檬酸在标准CSH苯基-己基柱(上)和CSH苯基-己基ACQUITY Premier柱(下)上的碎片光谱实例

 

用标准CSH苯基-己基柱(上)和CSH苯基-己基ACQUITY Premier柱(下)分离的尿液中柠檬酸的光谱库匹配的碎片得分。

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