利用新的质谱技术进行数据独立采集实验，推进全局研究并减少偏差

大卫-海伍德

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基于LC-MS的靶向检测越来越多地应用于发现后的Omics领域，重点是验证，这是转化研究中许多阶段中的第一个阶段；以及在药物开发和治疗方面，旨在获得对生物系统的理解的研究。

了解分析结果的背景是当前研究的动力，因此推动了LC-MS采集方法的发展，这些方法可以在一次实验中提供定性和定量的信息。

DIA-DDA-V2

数据独立采集（DIA）是一项关键技术，适用于需要定性识别复杂样品中的代谢物、脂质和蛋白质并提取高分辨率定量信息的实验室。

在DIA实验中，质谱仪的行为不会根据正在产生的数据而改变。这意味着结果不会有偏差，也不会因为质谱系统在采集模式或实验阈值限制之间的切换而丢失数据，这是数据依赖采集（DDA）方法所担心的。

一种新的采集模式，即二维质谱/质谱，由Richardson等人在2015年的ASMS上首次提出，最近作为Waters公司的SONAR 进行了商业化推广。

"随着蛋白质组学研究的成熟，科学家已经在收集蛋白质的大部分信息。他们希望能够做到的是带着假设接近一个蛋白质或特定的肽，并使用有针对性的MS/MS定量来调查他们的想法，而无需设置额外的方法或实验。

"现在，通过SONAR数据采集，他们可以进行选择性更强的一体式分析。与高速UPLC分离兼容，这是一个更有效的工作流程，可以在一次注射中进行更准确的定性和定量分析。"(摘自2016年世界HUPO大会)

在SONAR模式下，四极杆在感兴趣的m/z范围内快速扫描，低能量和高能量交替扫描，收集所有前体和所有产物的定性和定量数据。快速扫描电子装置每次扫描200个四极杆位置，典型的扫描时间为0.1到0.5秒（每个能量级）。四极杆的扫描速度>10,000阿姆/秒，>2000光谱/秒，与高速色谱和电泳分离兼容。

SONAR使研究人员能够进行高级数据处理，它与利用WatersProgenesis QI和Symphony软件的分析工作流程以及Skyline等第三方软件包兼容。SONAR可用于MassLynx软件控制下的WatersXevo G2-XS QTof质谱仪。

这种方法的优势在于以UPLC的速度提供定量的MS/MS数据，采用数据独立采集（DIA）方法，可用于高度复杂的样品。最近一篇题为《使用新型扫描四极杆DIA方法进行靶向全局定量的进展》的海报说明提供了更多信息。

在《蛋白质组学杂志》最近举办的题为《定性和定量蛋白质组学--用于复杂分析的新型DIA和处理策略》的网络研讨会上，来自Waters的James Langridge博士回顾了SONAR的工作原理，南安普顿大学蛋白质组研究中心的副教授/中心主任Paul Skipp博士讨论了它是如何实现人类皮肤蛋白质组的全球分析和定向定量的。

 

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