Quand les kits de consommables sont plus grands que la somme de leurs parties

Les kits ProteinWorks et GlycoWorks ne se limitent pas à la préparation des échantillons.

L'une des parties les plus difficiles d'un flux de travail LC-MS se produit avant même que les chimistes analytiques ne se tournent vers leur instrument : La préparation de l'échantillon. Si elle est correcte, l'analyse se déroule comme prévu. Si elle est mal faite, l'analyse présente un certain nombre de problèmes, allant d'une mauvaise sensibilité à une mauvaise reproductibilité.

Les défis posés par ces flux de travail pré-analytiques n'ont fait qu'augmenter, car le pipeline de développement de médicaments des organisations pharmaceutiques s'est déplacé vers les thérapies à grosses molécules.

Les laboratoires sont confrontés à des défis supplémentaires en raison de l'évolution du modèle commercial pharmaceutique. Les produits biopharmaceutiques sont plus grands et plus complexes que les médicaments à petites molécules, ce qui rend leur caractérisation et leur quantification plus difficiles. De plus, ce sont souvent les laboratoires traditionnels de "petites molécules", qui ont peu d'expérience dans le traitement des grosses molécules, qui sont invités à effectuer ces tests.

Les problèmes ne s'arrêtent pas à l'expertise scientifique ; les organisations doivent également naviguer dans les chaînes d'approvisionnement mondiales pour trouver des normes, des réactifs, des matériaux de référence et d'autres fournitures de laboratoire fiables (et rentables) qui garantiront la validation et la reproductibilité d'une méthode de préparation des échantillons.

" Ce que nous avons entendu de la part de beaucoup de nos clients, c'est qu'ils sont confrontés à la complexité de la caractérisation des biomolécules. Ils doivent développer des méthodologies, les valider, puis les transmettre à leur organisation ou à un collaborateur. En même temps, ils doivent gérer les coûts et travailler avec leurs chaînes d'approvisionnement pour savoir où se procurer les matériaux appropriés. Ces défis peuvent créer des problèmes coûteux", a commenté Mike Yelle, vice-président des consommables chez Waters Corporation.

Waters a choisi de résoudre ces problèmes en créant des kits d'application qui traitent la partie la plus complexe du processus : la préparation de l'échantillon.

S'appuyant sur le succès de longue date des kits pour l'analyse des acides aminés, Waters a introduit en 2015 des kits pour la caractérisation des N-glycanes libérés et pour la quantification des protéines dans les flux de travail bioanalytiques. Ces kits comprennent des normes, des réactifs, des matériaux de référence et des protocoles éprouvés ayant fait l'objet d'un contrôle de qualité, conçus pour permettre aux laboratoires de passer rapidement à la phase de pré-analyse en ayant la certitude que leurs méthodes sont hautement reproductibles et qu'elles peuvent être validées.

Le GlycoWorks™ RapiFluor-MS™ Released N-Glycan Kit offre des améliorations de flux de travail qui changent de paradigme par rapport à la caractérisation conventionnelle des glycoprotéines. Avec ce kit, qui comprend un réactif de marquage rapide ainsi qu'un protocole de déglycosylation et de nettoyage SPE, un analyste peut libérer les N-glycanes et les préparer pour l'analyse LC-FLR-MS en 30 minutes - une différence spectaculaire par rapport aux processus conventionnels de préparation des échantillons qui prennent jusqu'à un jour et demi. En outre, des gains de sensibilité MS peuvent être obtenus jusqu'à 200 fois par rapport aux étiquettes traditionnelles.

Grâce à ce kit, disponible en deux tailles, les analystes disposent de tout ce dont ils ont besoin pour caractériser les glycoprotéines avec des niveaux de sensibilité MS ou de fluorescence sans précédent, en conjonction avec un protocole simple et robuste.

Les kits de digestion ProteinWorks™ eXpress contiennent des réactifs prémesurés et traçables par lot, un module de collecte d'échantillons flexible de 96 tubes et des protocoles faciles à suivre qui permettent une digestion rapide et reproductible et une quantification précise et sensible des protéines dans les échantillons de plasma et de sérum immunopurifiés et entiers non immunopurifiés. Il existe un kit et un protocole µElution™ SPE optimisés en option, conçus pour augmenter la sensibilité du dosage, réduire les interférences de la matrice et améliorer la robustesse du système LC-MS.

Les kits constituent une solution idéale pour les laboratoires effectuant des analyses biologiques de protéines dans les entreprises innovantes et biosimilaires, les organismes de recherche sous contrat, les centres de recherche sur les maladies, les hôpitaux et les centres médicaux universitaires. L'exceptionnelle reproductibilité à un chiffre des kits ProteinWorks suggère qu'un haut degré de standardisation intra et inter-laboratoires est réalisable, ce qui rend le transfert de méthodes plus facile et plus réussi.

En outre, la faible sensibilité en ng/ml pour les anticorps monoclonaux et les temps de digestion de 10 minutes seulement pour les petites protéines en font une option attrayante et facile à mettre en œuvre pour une variété de domaines de recherche et de laboratoires différents. Les kits sont compatibles avec la quantification des anticorps totaux pour les conjugués anticorps-drogue.

"Certaines des innovations les plus puissantes pour les laboratoires d'aujourd'hui proviennent de la normalisation. Grâce à notre partenariat étroit avec nos clients, Waters est dans une position unique pour comprendre les processus pré-analytiques et analytiques des laboratoires modernes, et proposer des solutions qui peuvent simplifier les flux de travail les plus complexes. Nous travaillons tous ensemble pour aider à faire avancer les thérapies, plus rapidement et avec plus de confiance", a déclaré M. Yelle.

Cet article a été publié pour la première fois dans Pittcon Today, 3/6/2016.